More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20900 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20900  putative MFS transporter  100 
 
 		 388 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  49.87 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5596  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 380 aa  345  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3237  transporter of the MFS superfamily  46.21 
 
 		 380 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  50.27 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0795  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 403 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1178  major facilitator superfamily MFS_1  49.17 
 
 		 409 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0192681  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2287  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08030  arabinose efflux permease family protein  39.89 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.566013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 390 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  37.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  37.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  37.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  37.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  36.77 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  37.4 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  37 
 
 		 391 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  34.57 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 391 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  34.04 
 
 		 391 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 389 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  33.78 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  33.51 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 		 406 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  33.51 
 
 		 391 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  37.26 
 
 		 408 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 405 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  35.18 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  35.39 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  35.67 
 
 		 388 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5394  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326407  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  34.6 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  30.63 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  33.7 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  35.36 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  34.17 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  33.15 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  33.15 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  33.15 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0384  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 411 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  33.15 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  32.11 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  34.74 
 
 		 422 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 401 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  33.7 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  41.8 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  35.65 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  34.81 
 
 		 400 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  35.38 
 
 		 389 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  35.38 
 
 		 389 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  32.87 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 415 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>