89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  98.02 
 
 		 101 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  83.17 
 
 		 101 aa  176  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  79.21 
 
 		 101 aa  167  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  64.36 
 
 		 101 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  64.36 
 
 		 101 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  63.37 
 
 		 101 aa  136  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  63 
 
 		 107 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  62.38 
 
 		 101 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  63.37 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  61.39 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  57.43 
 
 		 99 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  56 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  55.45 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  51.49 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  50.54 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  52.27 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  47.19 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.61 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  44.83 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  39 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  39.36 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  37.37 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  36 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  45.65 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  42.35 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  40.7 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.44 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  29.79 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0411  hypothetical protein  35.16 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.368048  normal  0.907384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  31.82 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  31.82 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  31.82 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  32.95 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  32.95 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  30.49 
 
 		 568 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0278  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  33.33 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  29.89 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  22.73 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3203  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 250 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1771  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.03 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 249 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.52 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2094  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000638227  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2743  anti-sigma-factor antagonist  27.06 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 269 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.67 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.12 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  31.67 
 
 		 350 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  33.73 
 
 		 581 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  26.51 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  19.15 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2188  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 112 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 115 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  31.08 
 
 		 112 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  22.73 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0152  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  29.27 
 
 		 580 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2198  anti-sigma-factor antagonist  27.16 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  27.87 
 
 		 332 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  27.87 
 
 		 332 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2760  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.07 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  29.11 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  26.97 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  26.97 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3127  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 109 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 104 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 104 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>