48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18471 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  100 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  62.96 
 
 
191 aa  238  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  60.1 
 
 
195 aa  224  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  49.23 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  49.23 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  50.26 
 
 
191 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  39.38 
 
 
197 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  39.9 
 
 
203 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  38.5 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  37.95 
 
 
197 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  32.99 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  32.99 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  34.29 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  30.35 
 
 
211 aa  111  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  31.34 
 
 
206 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  30.06 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  32.56 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  27.6 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  30.54 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  24.49 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  29.85 
 
 
313 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  25.68 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  27.37 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  26.82 
 
 
276 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  21.47 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  28.08 
 
 
269 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  21.16 
 
 
217 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3837  hypothetical protein  28.09 
 
 
455 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  27.94 
 
 
276 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  26.79 
 
 
298 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  27.78 
 
 
303 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  27.78 
 
 
303 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.36 
 
 
273 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  27.68 
 
 
309 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.31 
 
 
334 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  27.21 
 
 
342 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  30.7 
 
 
275 aa  48.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.08 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1181  acetyltransferase or hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.96 
 
 
268 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.899858  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  20.97 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  24.88 
 
 
302 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  30.58 
 
 
357 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1213  putative lipase  29.84 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.137275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  26.26 
 
 
311 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  25.17 
 
 
356 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  24.46 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  23.08 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  23.86 
 
 
361 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>