111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18351 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 333 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  77.91 
 
 		 339 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  76.92 
 
 		 339 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  61.09 
 
 		 333 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  59.94 
 
 		 328 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  59.33 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  46.32 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  46.01 
 
 		 327 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  46.01 
 
 		 327 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.18 
 
 		 294 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.25 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.31 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  41.59 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  39.69 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.27 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 324 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.71 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.27 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.59 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.59 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  29.32 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.91 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 		 372 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.98 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 372 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.75 
 
 		 309 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.84 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2297  GDP-D-mannose dehydratase, putative  30.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3293  WcbK  30.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0531  putative GDP-D-mannose dehydratase  30.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1069  putative GDP-D-mannose dehydratase  30.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3279  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  30.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2175  putative GDP-D-mannose dehydratase  30.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3244  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  30.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  23.12 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  23.83 
 
 		 340 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.95 
 
 		 196 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03949  NAD(P)H steroid dehydrogenase  26.4 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  23.3 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0386  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 298 aa  45.8  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.9 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.65 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  22.41 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.27 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.13 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  37.33 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  28.69 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  25.83 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  27.55 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  22.94 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.21 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  24.67 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.22 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.34 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.95 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  23.44 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  32.89 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0169  putative transmembrane oxidoreductase protein  25.15 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  32.47 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.83 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0549  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.01 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1235  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.81 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.747761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.24 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.67 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  31.36 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  27.59 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>