42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10581 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  100 
 
 
191 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  53.48 
 
 
191 aa  217  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  51.34 
 
 
195 aa  209  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  51.14 
 
 
206 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  45.21 
 
 
200 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  45.21 
 
 
200 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  40.96 
 
 
197 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  40.43 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  40.43 
 
 
203 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  39.36 
 
 
197 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  31.22 
 
 
206 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  27.27 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  27.66 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  26.74 
 
 
216 aa  85.1  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  27.13 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  27.66 
 
 
191 aa  84.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  26.74 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  26.2 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  26.88 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  32.17 
 
 
309 aa  65.1  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  27.49 
 
 
281 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  26.95 
 
 
276 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  32.03 
 
 
334 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  26.67 
 
 
303 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  26.09 
 
 
313 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  27.42 
 
 
303 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  27.27 
 
 
298 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  26.71 
 
 
356 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  26.02 
 
 
342 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  30.11 
 
 
286 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  26.36 
 
 
339 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  22.93 
 
 
269 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  21.23 
 
 
217 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  25.22 
 
 
225 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  22.97 
 
 
223 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  27.93 
 
 
302 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  27.03 
 
 
304 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  28.97 
 
 
442 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  25.2 
 
 
361 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  22.41 
 
 
222 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  25 
 
 
276 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  21.71 
 
 
222 aa  41.2  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>