More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4284 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4284  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 351 aa  713    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4277  LacI family transcription regulator  62.28 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3108  transcriptional regulators-like protein  54.09 
 
 		 323 aa  355  8.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4310  LacI family transcription regulator  38.15 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4286  LacI family transcription regulator  44.31 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3203  LacI family transcription regulator  36.13 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0127391  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4311  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3374  LacI family transcription regulator  37.22 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1990  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1018  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1384  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.934353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4267  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 		 330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1357  LacI family transcription regulator  31.49 
 
 		 357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4343  LacI family transcription regulator  30.59 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.905515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0521  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0520  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1623  transcriptional regulator, LacI family  25.28 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  24.83 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0307  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0353911  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3720  transcriptional regulator, LacI family  29.2 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  26.78 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  30.54 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3344  LacI family transcription regulator  24.85 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000247508  normal  0.28725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1273  transcriptional regulator  24.55 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690479  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  24.12 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  22.69 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4618  regulatory protein LacI  29.9 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  24.19 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06445  LacI family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.43 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  27.49 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  23.98 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1148  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.97 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.907007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  27.24 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5093  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  23.46 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  32 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  27.6 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  26.61 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2351  LacI family transcription regulator  25.28 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0288432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0194  LacI family transcription regulator  23.94 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  25.41 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  26.32 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3955  transcriptional regulator, LacI family  26.57 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337972  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1892  transcriptional regulator, LacI family  23.6 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2762  alanine racemase  27.46 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5100  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  20.42 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  23.35 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3918  LacI family transcription regulator  26.48 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  25.25 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  26.07 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5083  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  20.42 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000690772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  26.04 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  46.75 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  27.59 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  23.12 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  24.88 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.88 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.52 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.46 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  23.47 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.68 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  22.49 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  28.22 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  23.96 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  26.88 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  27.39 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  24.02 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  23.19 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  23.88 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0232  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  22.37 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4217  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5497  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  19.7 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0234  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  22.53 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.762891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  28.64 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.8 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  27.21 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  28.64 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5581  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  20.42 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.44232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  21.18 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5531  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  20.41 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.264023  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  24.62 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  24.83 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0208  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  21.91 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0194  periplasmic-binding protein/LacI transcriptional regulator  21.91 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0216  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  21.91 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  25.45 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1372  galactose operon repressor  22.8 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0385  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.04 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0252  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  22.18 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0227  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  21.91 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2556  transcriptional regulator, LacI family  19.16 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000904675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>