48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2925 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  100 
 
 		 799 aa  1629    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  40.92 
 
 		 780 aa  582  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  44.37 
 
 		 610 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  42.49 
 
 		 613 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  40.87 
 
 		 586 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  39.39 
 
 		 632 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  42.24 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  39.9 
 
 		 612 aa  427  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  40.07 
 
 		 612 aa  429  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  41.91 
 
 		 643 aa  420  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  41.14 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  39.62 
 
 		 625 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  40.86 
 
 		 576 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  37.61 
 
 		 584 aa  376  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  40.58 
 
 		 580 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  39.2 
 
 		 579 aa  355  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  36.01 
 
 		 598 aa  347  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  37.18 
 
 		 586 aa  343  9e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  35.03 
 
 		 631 aa  306  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  36.36 
 
 		 898 aa  203  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  34.07 
 
 		 924 aa  171  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  31.14 
 
 		 892 aa  145  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  33.51 
 
 		 1392 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  35.02 
 
 		 827 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  28.73 
 
 		 801 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  31.29 
 
 		 996 aa  127  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  38.29 
 
 		 832 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  28.53 
 
 		 985 aa  114  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  32.98 
 
 		 796 aa  108  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  37.08 
 
 		 808 aa  104  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  33.71 
 
 		 739 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  32.43 
 
 		 802 aa  99.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  27.98 
 
 		 672 aa  87.4  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  36.69 
 
 		 837 aa  87.4  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  30.23 
 
 		 951 aa  83.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  36 
 
 		 600 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.56 
 
 		 805 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.37 
 
 		 1264 aa  61.2  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  24.87 
 
 		 682 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  37.35 
 
 		 534 aa  57  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  29.92 
 
 		 644 aa  55.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  36.71 
 
 		 591 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.14 
 
 		 1289 aa  49.3  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  26.47 
 
 		 569 aa  49.3  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.72 
 
 		 687 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  26.53 
 
 		 925 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  26.98 
 
 		 534 aa  45.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  35.38 
 
 		 1937 aa  44.7  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>