More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0319 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0319  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  782    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331177  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  35.4 
 
 
406 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 
406 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  37.1 
 
 
405 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  38.04 
 
 
409 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
406 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  34.75 
 
 
406 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  36.34 
 
 
409 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  34.74 
 
 
402 aa  222  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  38.86 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  35.29 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  38.52 
 
 
409 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  36.67 
 
 
409 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  35.86 
 
 
405 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  38.04 
 
 
409 aa  215  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  36.43 
 
 
409 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  37.28 
 
 
406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  33.75 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  34.35 
 
 
391 aa  213  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  35.98 
 
 
409 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  33.75 
 
 
398 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  36.19 
 
 
409 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  34.32 
 
 
408 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  36.72 
 
 
401 aa  210  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  36.5 
 
 
409 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  35.7 
 
 
651 aa  210  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  33.5 
 
 
410 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  34.23 
 
 
406 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  34.89 
 
 
405 aa  209  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  33.25 
 
 
410 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  39.39 
 
 
671 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  35.7 
 
 
410 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  37.35 
 
 
408 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  34.56 
 
 
405 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  31.9 
 
 
657 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  34.56 
 
 
405 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  34.98 
 
 
658 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  32.69 
 
 
409 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.51 
 
 
656 aa  202  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  35.56 
 
 
409 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  35.71 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  36.72 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  35.57 
 
 
407 aa  199  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  35.22 
 
 
652 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  36.74 
 
 
405 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  32.84 
 
 
653 aa  199  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  34.35 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  34.35 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  34.26 
 
 
647 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  35.84 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  35.61 
 
 
409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  34.8 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  35.37 
 
 
401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  32.84 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  35.18 
 
 
402 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  34.8 
 
 
405 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  34.75 
 
 
400 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  34.6 
 
 
657 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  37.41 
 
 
403 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  33.67 
 
 
409 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  33.67 
 
 
409 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.68 
 
 
403 aa  192  8e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  36.67 
 
 
411 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  34.84 
 
 
405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  32.93 
 
 
654 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  33.84 
 
 
661 aa  189  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 
654 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.14 
 
 
656 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  37.53 
 
 
403 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  34.83 
 
 
399 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  32.34 
 
 
657 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  32.66 
 
 
670 aa  186  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  34.01 
 
 
644 aa  186  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  34.22 
 
 
656 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  34.69 
 
 
643 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  34.64 
 
 
667 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  34.33 
 
 
653 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  34.25 
 
 
663 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  34.74 
 
 
682 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  34.64 
 
 
667 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  31.6 
 
 
707 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  34.64 
 
 
682 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  31.9 
 
 
656 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  29.57 
 
 
715 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 
397 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  34.47 
 
 
402 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  33.25 
 
 
663 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  34.47 
 
 
402 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  34.87 
 
 
654 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  32.5 
 
 
657 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  34 
 
 
647 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
412 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32.74 
 
 
648 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32.74 
 
 
648 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  32.08 
 
 
649 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.76 
 
 
443 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  32.74 
 
 
402 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  32.91 
 
 
657 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  30.84 
 
 
454 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>