More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0114 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0114  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
357 aa  728    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  45.73 
 
 
341 aa  272  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  44.84 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4660  oxidoreductase domain protein  37.06 
 
 
374 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0048  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
364 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
347 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 
347 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  32.64 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3409  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.137332  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  25.36 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  32.93 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  22.48 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.63 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 
342 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  24.08 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0095  dehydrogenase and related proteins-like  27.73 
 
 
326 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0526429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  25.72 
 
 
310 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  34.13 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  22.07 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 
389 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  26.06 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  22.92 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  28.64 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  23.91 
 
 
364 aa  60.1  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  21.59 
 
 
349 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3733  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 
343 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  22.63 
 
 
344 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  22.56 
 
 
337 aa  59.7  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 
363 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 
699 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  22.76 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  23.66 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  21.62 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 
699 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  21.62 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  22.1 
 
 
338 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 
424 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.99 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.5 
 
 
353 aa  56.2  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  30.91 
 
 
347 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 
334 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.65 
 
 
428 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  22.78 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.02 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  23.73 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  28.66 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 
329 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  28.93 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  35.05 
 
 
379 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  30.95 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  23.32 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  21.81 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.42 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  22.91 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  22.91 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  28.66 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  28.66 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  28.66 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  23.67 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
319 aa  53.5  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  24.19 
 
 
330 aa  53.9  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  34.17 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  41.67 
 
 
334 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 
352 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
337 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>