More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4350 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
314 aa  630  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  82.17 
 
 
314 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  65.36 
 
 
313 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  62.9 
 
 
328 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  62.9 
 
 
328 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  62.54 
 
 
317 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  62.9 
 
 
328 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  62.9 
 
 
317 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  62.9 
 
 
328 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  62.9 
 
 
328 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  62.9 
 
 
328 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  62.9 
 
 
328 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  62.77 
 
 
317 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  63.29 
 
 
312 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  62.41 
 
 
317 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  62.77 
 
 
347 aa  362  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  62.06 
 
 
317 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  60.94 
 
 
315 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  59.08 
 
 
313 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  61.97 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  62.9 
 
 
313 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  61.27 
 
 
313 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  61.27 
 
 
313 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  59.07 
 
 
311 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  55.97 
 
 
311 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  56.03 
 
 
309 aa  311  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  54.51 
 
 
326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  53.76 
 
 
311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  51.52 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.97 
 
 
311 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.97 
 
 
311 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  51.97 
 
 
311 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.97 
 
 
311 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.52 
 
 
309 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.97 
 
 
397 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  52.52 
 
 
313 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  51.97 
 
 
311 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  51.97 
 
 
406 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  52.52 
 
 
313 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.33 
 
 
314 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  54.48 
 
 
312 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  58.04 
 
 
324 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  52.69 
 
 
310 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  52.69 
 
 
310 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  52.69 
 
 
310 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  52.48 
 
 
326 aa  288  9e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  53.99 
 
 
326 aa  285  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  53.26 
 
 
327 aa  281  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  50.85 
 
 
315 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  55.29 
 
 
308 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  54.84 
 
 
310 aa  275  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  49.11 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  52.94 
 
 
315 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  48.14 
 
 
301 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  49.63 
 
 
311 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  47.93 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  47.02 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  52.96 
 
 
335 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  44.68 
 
 
332 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  45.61 
 
 
295 aa  231  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  42.07 
 
 
339 aa  215  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  41.18 
 
 
354 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  40.16 
 
 
348 aa  188  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  41.27 
 
 
734 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  40.84 
 
 
331 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  37.99 
 
 
337 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  33.78 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  30.12 
 
 
323 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  29.55 
 
 
312 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
302 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  31.98 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.62 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.62 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.62 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.62 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.19 
 
 
266 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.19 
 
 
266 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.19 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  36.14 
 
 
266 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  27.59 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.76 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.76 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.76 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  29.84 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.43 
 
 
257 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  38.06 
 
 
263 aa  86.3  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.93 
 
 
266 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.93 
 
 
266 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.93 
 
 
266 aa  86.3  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
306 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  34.34 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  27.2 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  32.34 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  30.9 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  30.9 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  29.37 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  29.11 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>