126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43341 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  100 
 
 
333 aa  682    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  100 
 
 
333 aa  682    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 
309 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 
311 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
310 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 
309 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
310 aa  173  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  33.96 
 
 
313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  36.53 
 
 
404 aa  155  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  32.66 
 
 
301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  30.63 
 
 
361 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  35.02 
 
 
306 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  33.93 
 
 
307 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  33.48 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  29.11 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  28.98 
 
 
306 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  29.76 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  27.39 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  28.24 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  31.82 
 
 
323 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.82 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.24 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 
321 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
337 aa  56.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
329 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  26.56 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.84 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  26.67 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
327 aa  53.1  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
319 aa  53.1  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00831994  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  30.77 
 
 
287 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  27.5 
 
 
255 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.1 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.74 
 
 
313 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
298 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 
313 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.15 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
327 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
320 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 
339 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.36 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  27.81 
 
 
316 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
369 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  25.13 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
330 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  28.1 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.1 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.75 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.74 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0526  GTP-binding protein  23.39 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3899  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.56 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.49 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.57 
 
 
345 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.68 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>