More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_16978 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  100 
 
 
352 aa  713    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  43.97 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  43.97 
 
 
405 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  47.08 
 
 
364 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  44.19 
 
 
374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.89 
 
 
370 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  46.35 
 
 
380 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  45.95 
 
 
350 aa  232  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  43.3 
 
 
370 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.59 
 
 
292 aa  185  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.09 
 
 
292 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  37.92 
 
 
312 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  36.6 
 
 
313 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  37.92 
 
 
312 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  40.94 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00231  GTPase  41.11 
 
 
321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0026  GTPase EngC  41.01 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.52 
 
 
294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.48 
 
 
293 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0022  GTPase EngC  39.16 
 
 
300 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.73 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  36.4 
 
 
287 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.45 
 
 
282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.15 
 
 
288 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 
287 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.07 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  36.92 
 
 
293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  36.92 
 
 
293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  36.92 
 
 
293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  36.59 
 
 
293 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  37.86 
 
 
293 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  36.56 
 
 
293 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  36.56 
 
 
293 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  36.56 
 
 
293 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  36.56 
 
 
293 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00181  GTPase  32 
 
 
305 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 
293 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 
293 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  36.43 
 
 
293 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.55 
 
 
293 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00181  GTPase  30.43 
 
 
305 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0019  GTPase EngC  29.82 
 
 
305 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00181  GTPases  30.88 
 
 
305 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.655275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.27 
 
 
295 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.27 
 
 
293 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.53 
 
 
290 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.19 
 
 
306 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  36.3 
 
 
290 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.1 
 
 
305 aa  149  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 
294 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.93 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.13 
 
 
296 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.04 
 
 
300 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.24 
 
 
300 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  32.28 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.24 
 
 
319 aa  139  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.55 
 
 
288 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 
290 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.09 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 
307 aa  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  35.63 
 
 
353 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  34.04 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.96 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  31.74 
 
 
337 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  31.79 
 
 
352 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  31.25 
 
 
352 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  33.71 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  31.54 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  31.51 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.22 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.44 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  32.59 
 
 
306 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  33.1 
 
 
354 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  32.87 
 
 
354 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  33.21 
 
 
311 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  30.69 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  32.53 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.81 
 
 
308 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.88 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  32.41 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  33.2 
 
 
350 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  32.99 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  32.99 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  32.71 
 
 
340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  32.99 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  32.71 
 
 
354 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  32.71 
 
 
354 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  32.34 
 
 
354 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  31.38 
 
 
350 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  31.38 
 
 
350 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  31.38 
 
 
350 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  31.38 
 
 
350 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  31.38 
 
 
350 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  31.38 
 
 
350 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.03 
 
 
350 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  31.03 
 
 
350 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  31.54 
 
 
319 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  31.49 
 
 
354 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  30.1 
 
 
351 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>