More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0792 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  77.49 
 
 
395 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0651  elongation factor Tu  86.36 
 
 
396 aa  680    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000337363  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  100 
 
 
396 aa  795    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  85.35 
 
 
396 aa  695    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0627  elongation factor Tu  82.19 
 
 
395 aa  652    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  78.01 
 
 
395 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  76.01 
 
 
400 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  76.01 
 
 
400 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  78.26 
 
 
395 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  78.52 
 
 
395 aa  617  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  75.57 
 
 
396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  75.57 
 
 
396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  75.57 
 
 
396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  75.57 
 
 
396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0762  elongation factor Tu  76.2 
 
 
398 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000170202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  73.99 
 
 
400 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  74.24 
 
 
400 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  74.31 
 
 
400 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  74.12 
 
 
400 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0524  elongation factor Tu  76.96 
 
 
398 aa  604  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00168014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  74.75 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  74.3 
 
 
396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  74.3 
 
 
396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  71.86 
 
 
400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  71.5 
 
 
394 aa  599  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  73.72 
 
 
395 aa  597  1e-170  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  74.24 
 
 
400 aa  597  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  74.24 
 
 
400 aa  597  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  75.13 
 
 
400 aa  597  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  71.61 
 
 
400 aa  598  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  75.13 
 
 
400 aa  598  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  73.4 
 
 
394 aa  596  1e-169  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  72.59 
 
 
397 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.05 
 
 
400 aa  595  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  75.19 
 
 
395 aa  596  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  71.72 
 
 
397 aa  591  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.13 
 
 
397 aa  591  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  72.01 
 
 
395 aa  592  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  75.57 
 
 
396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  75.57 
 
 
396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  75.25 
 
 
400 aa  591  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.13 
 
 
397 aa  591  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  73.47 
 
 
396 aa  590  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  72.8 
 
 
400 aa  590  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.08 
 
 
396 aa  589  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  72.8 
 
 
400 aa  590  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  70.84 
 
 
395 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  73.47 
 
 
396 aa  590  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  72.22 
 
 
399 aa  585  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  71.65 
 
 
397 aa  587  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  71.65 
 
 
397 aa  587  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  71.76 
 
 
397 aa  584  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  73.79 
 
 
396 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  72.52 
 
 
396 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  71.46 
 
 
399 aa  586  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  72.22 
 
 
400 aa  584  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  70.33 
 
 
394 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  70.33 
 
 
394 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  70.33 
 
 
394 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  70.33 
 
 
394 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  73.79 
 
 
395 aa  585  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  69.83 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  71.79 
 
 
400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  73.66 
 
 
395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  71.97 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  72.01 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  73.4 
 
 
395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  73.4 
 
 
395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  73.4 
 
 
395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  73.4 
 
 
395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  72.01 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  72.01 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  73.4 
 
 
395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0178  elongation factor Tu  74.81 
 
 
393 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000251957  normal  0.724836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1853  elongation factor Tu  74.55 
 
 
393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000429764  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  72.01 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  73.4 
 
 
395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  72.01 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  72.01 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  73.15 
 
 
395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  73.66 
 
 
395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  71.76 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  71.76 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  71.76 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  71.5 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  70.96 
 
 
399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0103  elongation factor Tu  73.4 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  71.76 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  72.19 
 
 
395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  72.19 
 
 
395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  71.97 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  71.76 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  71.76 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  72.01 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  69.83 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  70.96 
 
 
399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  71.25 
 
 
396 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  75.32 
 
 
396 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  71.39 
 
 
396 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  71.39 
 
 
396 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>