81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0694 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0238705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  34.56 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  33.08 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0183  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.87 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  32.39 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  29.79 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.83 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  29.79 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  29.79 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.84 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  29.79 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  29.79 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  29.79 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  29.79 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  29.79 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  29.79 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.41 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.15 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.32 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  27.41 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.77 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  27.61 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  32.03 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.33 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  31.06 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  32.03 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  32.03 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  31.06 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  31.06 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.74 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  31.06 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.01 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  30.83 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  31.06 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  27.82 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.86 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.57 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  27.48 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4766  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  30.08 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.55 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  31.34 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.55 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  31.34 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  31.34 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  31.34 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  25.55 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0097  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 152 aa  43.5  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0624  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  0.570271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  35.14 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>