137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0270 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
400 aa  756    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3197  sodium/hydrogen exchanger  47.83 
 
 
391 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000344959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0193  sodium/hydrogen exchanger  49.74 
 
 
394 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  44.56 
 
 
394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3111  sodium/hydrogen exchanger  44.35 
 
 
390 aa  270  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000824463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  41.84 
 
 
396 aa  268  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  41.46 
 
 
543 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2353  hypothetical protein  39.76 
 
 
541 aa  246  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1529  sodium/hydrogen exchanger  38.42 
 
 
503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2186  Na+/H+-exchanging protein  35.84 
 
 
545 aa  209  8e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.601594 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40732  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  32.49 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00131155 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30420  predicted protein  29.75 
 
 
328 aa  103  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726911  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  23.64 
 
 
498 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  23.15 
 
 
597 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 
496 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.33 
 
 
386 aa  63.2  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.06 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  22.51 
 
 
596 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  22.31 
 
 
612 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 
641 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  23.91 
 
 
597 aa  59.7  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 
760 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  25.22 
 
 
611 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  25.22 
 
 
611 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.45 
 
 
763 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  22.73 
 
 
478 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  23.42 
 
 
431 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  24.44 
 
 
581 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  24.73 
 
 
477 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 
741 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 
611 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 
764 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  25 
 
 
597 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  23.28 
 
 
601 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
602 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 
599 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
652 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  24.86 
 
 
581 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  23.88 
 
 
601 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
652 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  25.73 
 
 
531 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  25.51 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  21.04 
 
 
598 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  23.58 
 
 
608 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0702  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 
411 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  23.28 
 
 
601 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  23.55 
 
 
597 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  30.9 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  25.32 
 
 
602 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.56 
 
 
414 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 
619 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 
651 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 
445 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  23.6 
 
 
576 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.46 
 
 
596 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  23.56 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  23.67 
 
 
608 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  25.22 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.71 
 
 
666 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0483  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  22.55 
 
 
481 aa  50.1  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  22.93 
 
 
689 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  24.76 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 
386 aa  50.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.69 
 
 
596 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.69 
 
 
596 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
406 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  22.69 
 
 
596 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.44 
 
 
596 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.44 
 
 
596 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  23.48 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  24.44 
 
 
527 aa  48.9  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  23.46 
 
 
597 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  22.5 
 
 
596 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  24.6 
 
 
637 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  23.42 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  23.27 
 
 
610 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  23.76 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  24.37 
 
 
445 aa  47.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  22.58 
 
 
597 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 
416 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 
391 aa  46.6  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 
629 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  22.92 
 
 
625 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  26.04 
 
 
417 aa  46.6  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  29.95 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 
692 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  24.85 
 
 
607 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  24.28 
 
 
506 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.07 
 
 
655 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  24.38 
 
 
576 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  24.63 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  23.03 
 
 
577 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>