More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4575 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4575  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3557  extracellular solute-binding protein family 3  58.27 
 
 
290 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.838933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0757  extracellular solute-binding protein  60.43 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.953109  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2775  extracellular solute-binding protein family 3  53.76 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9353  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein, putative  55.56 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3098  extracellular solute-binding protein family 3  53.01 
 
 
293 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6884  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 
285 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5107  extracellular solute-binding protein  45.93 
 
 
286 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0875  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  34.78 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00496425  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0661  extracellular solute-binding protein family 3  34.51 
 
 
279 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000289878  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2804  extracellular solute-binding protein family 3  30.09 
 
 
276 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  33.64 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.45 
 
 
266 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 
285 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.16 
 
 
503 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 
250 aa  89.7  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 
247 aa  89.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.3 
 
 
266 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  31.88 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.12 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 
247 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  30.99 
 
 
258 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.12 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  31.18 
 
 
502 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  31.18 
 
 
502 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.4 
 
 
503 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  30.65 
 
 
265 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
253 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 
252 aa  85.9  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  30.99 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  34.59 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  32.17 
 
 
246 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  29.15 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.73 
 
 
251 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  30.6 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.84 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.84 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.84 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.84 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.84 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  30.77 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.52 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  30.77 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  30.77 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.84 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  27.55 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.32 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.45 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.45 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.55 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.47 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.29 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.45 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.54 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  30.36 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.8 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.52 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0125  extracellular solute-binding protein family 3  35.19 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>