More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4533 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
508 aa  980    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  52.35 
 
 
488 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  48.92 
 
 
523 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  47.21 
 
 
542 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  45.68 
 
 
554 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.02 
 
 
511 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.22 
 
 
509 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.88 
 
 
531 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.78 
 
 
508 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.86 
 
 
525 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  44.91 
 
 
534 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  44.49 
 
 
531 aa  363  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  44.29 
 
 
528 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.78 
 
 
545 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.14 
 
 
512 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  48.05 
 
 
531 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  44.03 
 
 
570 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  43.16 
 
 
512 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.16 
 
 
512 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.16 
 
 
512 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.23 
 
 
505 aa  333  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.35 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.42 
 
 
520 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  45.82 
 
 
538 aa  322  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.8 
 
 
515 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.2 
 
 
521 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  44.53 
 
 
524 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  53.8 
 
 
546 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.68 
 
 
552 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.64 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  49.68 
 
 
608 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  49.05 
 
 
501 aa  280  6e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.47 
 
 
465 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.69 
 
 
501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  32.81 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 
528 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  31.92 
 
 
505 aa  153  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.35 
 
 
512 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  33.23 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  32.72 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  34.81 
 
 
370 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.44 
 
 
400 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  32.14 
 
 
338 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.84 
 
 
376 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  32.7 
 
 
361 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  32.73 
 
 
420 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.45 
 
 
335 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.02 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  30.14 
 
 
453 aa  98.2  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  30.42 
 
 
403 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  29.91 
 
 
402 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  29.05 
 
 
369 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.9 
 
 
414 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  34.16 
 
 
430 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 
369 aa  97.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.32 
 
 
369 aa  96.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.99 
 
 
400 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.54 
 
 
412 aa  95.1  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 
426 aa  93.6  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 
451 aa  92  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.41 
 
 
359 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.94 
 
 
415 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  31.1 
 
 
437 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  30.32 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.11 
 
 
200 aa  90.9  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.04 
 
 
419 aa  90.5  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  31.34 
 
 
449 aa  90.5  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  30.32 
 
 
449 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  28.94 
 
 
402 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.53 
 
 
207 aa  89.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  29.96 
 
 
451 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  33.46 
 
 
425 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  29.26 
 
 
403 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  29.5 
 
 
409 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30.89 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  32.85 
 
 
440 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.3 
 
 
453 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  33.21 
 
 
425 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  27.1 
 
 
363 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  32.72 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  33.83 
 
 
231 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.77 
 
 
406 aa  87.8  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.18 
 
 
230 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  28.38 
 
 
437 aa  87  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  27.67 
 
 
412 aa  86.7  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.06 
 
 
209 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  30.07 
 
 
425 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  31.35 
 
 
406 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.35 
 
 
402 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  29.22 
 
 
431 aa  86.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  29.82 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.56 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.07 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  34.32 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  27.56 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  29.73 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.78 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.29 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>