182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3455 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3455  major facilitator transporter  100 
 
 		 369 aa  704    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  41.8 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  42.9 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  44.48 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  43.05 
 
 		 411 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  38.63 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  37.47 
 
 		 419 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 		 406 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 496 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  37.91 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  35.79 
 
 		 409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  39.89 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  38.44 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  37.72 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  38.74 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  35.52 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 445 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  38.5 
 
 		 424 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  36.22 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  34.22 
 
 		 403 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  38.44 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14270  cyanate permease  32.46 
 
 		 423 aa  159  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000572632  normal  0.0539655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  36.62 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  36.34 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  36.34 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  36.34 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  36.34 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  36.34 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  36.34 
 
 		 393 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03160  cyanate permease  34.14 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  36.06 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  35.18 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  39.07 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  34.9 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  35.77 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  34.9 
 
 		 394 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  34.9 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  34.63 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  33.99 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  35 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  35.95 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  36.72 
 
 		 426 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 402 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 361 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 439 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 430 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  32.17 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  31.88 
 
 		 382 aa  135  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3103  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 423 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  34.58 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  29.08 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  29.09 
 
 		 397 aa  129  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 434 aa  126  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  25.14 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 429 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>