218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0765 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
443 aa  856    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  38.79 
 
 
449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.89 
 
 
444 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0984  flagellar hook-associated 2 domain protein  37.74 
 
 
469 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31280  flagellar capping protein  34.96 
 
 
460 aa  204  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1627  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.56 
 
 
523 aa  183  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0835  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.32 
 
 
664 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2353  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.31 
 
 
430 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  30.46 
 
 
487 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.46 
 
 
447 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.54 
 
 
462 aa  153  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  30.17 
 
 
469 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.04 
 
 
473 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  28.85 
 
 
441 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.67 
 
 
457 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  27.94 
 
 
458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.69 
 
 
452 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  30.13 
 
 
445 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  28.82 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  29.61 
 
 
456 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.13 
 
 
456 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  32.96 
 
 
452 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.43 
 
 
451 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  28.92 
 
 
490 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.95 
 
 
475 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.8 
 
 
451 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  33.33 
 
 
632 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.1 
 
 
451 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  28.6 
 
 
495 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  30.4 
 
 
452 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  32.01 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  27.97 
 
 
458 aa  120  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  28.3 
 
 
466 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  28.09 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  28.51 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.1 
 
 
454 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.28 
 
 
458 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.1 
 
 
454 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.23 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.8 
 
 
478 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  29.81 
 
 
471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.99 
 
 
482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  21.27 
 
 
487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.79 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.84 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.32 
 
 
438 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.01 
 
 
456 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  28.47 
 
 
448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.72 
 
 
473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.83 
 
 
453 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.89 
 
 
456 aa  113  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.26 
 
 
657 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.05 
 
 
448 aa  113  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.44 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.01 
 
 
479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.84 
 
 
479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0114  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.2 
 
 
852 aa  111  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  27.27 
 
 
445 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.02 
 
 
455 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  25.92 
 
 
462 aa  110  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.17 
 
 
468 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  26.75 
 
 
465 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  27.19 
 
 
437 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  28.54 
 
 
498 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  27.67 
 
 
474 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  26.28 
 
 
478 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  26.39 
 
 
442 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  30.15 
 
 
468 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  28.6 
 
 
471 aa  107  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.53 
 
 
467 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.07 
 
 
457 aa  106  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  27.31 
 
 
446 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  30.15 
 
 
468 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.54 
 
 
477 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.26 
 
 
463 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  30.15 
 
 
468 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  30.15 
 
 
468 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.54 
 
 
468 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  28.63 
 
 
505 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.51 
 
 
479 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  29.71 
 
 
477 aa  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.72 
 
 
472 aa  103  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  29.07 
 
 
441 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  29.07 
 
 
441 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.7 
 
 
448 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.21 
 
 
505 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  27.68 
 
 
677 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.86 
 
 
472 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.22 
 
 
554 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.29 
 
 
488 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  26.67 
 
 
487 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  26.38 
 
 
471 aa  100  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.56 
 
 
470 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.32 
 
 
519 aa  99.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.55 
 
 
476 aa  99.8  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.1 
 
 
465 aa  99.8  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  27.2 
 
 
477 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.29 
 
 
472 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1706  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32 
 
 
551 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.31 
 
 
477 aa  94.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>