More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0545 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  586  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  44.26 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  39.13 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  40.2 
 
 		 309 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  40.2 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  39.39 
 
 		 305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  42.62 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  42.62 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.25 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  41.28 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  38.51 
 
 		 317 aa  182  8.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  40.59 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37.58 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  39 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  38.67 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  42.4 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  37.67 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  39.93 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  40 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  38.02 
 
 		 313 aa  175  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  37.92 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  36.42 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  42.28 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  38 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  37.04 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  37.58 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  37.58 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  36.84 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  35.67 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  38.82 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  38.82 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  34.51 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  37.9 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  35.91 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  42.18 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  42.18 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  37.21 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  41.61 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  41.61 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  32.67 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  32.21 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  40 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  33.56 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  40.8 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  35.67 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  38.75 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  38.74 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  37.87 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  34.22 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  35.33 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  36.52 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  34.81 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  37.67 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  38.26 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  36.42 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  39.53 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  36.42 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  34.9 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  38.05 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  39.14 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  35.67 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  39.4 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  36.79 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  39.34 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  34.56 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  36.75 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  36.75 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  30.07 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  36.79 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  35.23 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  36.88 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  39.19 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  36.54 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  31.21 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  40.75 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  42.05 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  35.94 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  36.45 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  33.33 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  36.3 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40.54 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  39.06 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  36.45 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  36.45 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  38.65 
 
 		 320 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  36.45 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  38.65 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  39.26 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  33.22 
 
 		 403 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  32.39 
 
 		 403 aa  155  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  37.33 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  36.12 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  36.12 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  39.01 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  36.12 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  38.65 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  39.6 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  32.87 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>