More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0355 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  100 
 
 		 505 aa  957    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  63.35 
 
 		 499 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  62.47 
 
 		 492 aa  522  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  59.66 
 
 		 488 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  59.06 
 
 		 498 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  54.63 
 
 		 546 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  54.84 
 
 		 546 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  53.47 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  61.81 
 
 		 580 aa  329  7e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.15 
 
 		 518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  60.54 
 
 		 575 aa  282  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  56.27 
 
 		 573 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  66.67 
 
 		 578 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  66.67 
 
 		 578 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  66.67 
 
 		 578 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  63.82 
 
 		 580 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  63.78 
 
 		 580 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  70.11 
 
 		 580 aa  239  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  49.51 
 
 		 603 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  45.81 
 
 		 591 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  39.41 
 
 		 693 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  50 
 
 		 579 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  48.06 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  46.15 
 
 		 562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  31.3 
 
 		 584 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  30.77 
 
 		 584 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  30.22 
 
 		 584 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  31.96 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  32.64 
 
 		 553 aa  191  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.25 
 
 		 541 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.79 
 
 		 659 aa  189  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  31.26 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  47.51 
 
 		 614 aa  188  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.99 
 
 		 539 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  30.82 
 
 		 665 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  32.05 
 
 		 541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  34.2 
 
 		 515 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  32.08 
 
 		 559 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  31.58 
 
 		 551 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  30.45 
 
 		 661 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  30.46 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.36 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  31.21 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  31.6 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  31.16 
 
 		 551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  31.84 
 
 		 554 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  30.43 
 
 		 516 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  30.49 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.56 
 
 		 530 aa  180  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  29.03 
 
 		 548 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  31.6 
 
 		 554 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  32.92 
 
 		 513 aa  179  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  32.18 
 
 		 566 aa  179  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  31.58 
 
 		 584 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  31.8 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  30.2 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  31.8 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  30.2 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  30.02 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  33.15 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  30.2 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.27 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  35.25 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  30.58 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  30.2 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  30.2 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.98 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34 
 
 		 515 aa  178  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.27 
 
 		 516 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  31.98 
 
 		 563 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  32.78 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  31.09 
 
 		 564 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.03 
 
 		 560 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  31.88 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  32.73 
 
 		 554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  31 
 
 		 537 aa  173  7.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  31.74 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.74 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  34.64 
 
 		 551 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  31.74 
 
 		 664 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  30.53 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  31.17 
 
 		 561 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  30.91 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  31.67 
 
 		 665 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  31.17 
 
 		 574 aa  170  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  30.77 
 
 		 552 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  30.36 
 
 		 573 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5152  SSS sodium solute transporter superfamily  34.59 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35030  cation/acetate symporter ActP  31.02 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.89065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  31.64 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.87 
 
 		 554 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  31.4 
 
 		 561 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  32.53 
 
 		 568 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  30.82 
 
 		 550 aa  167  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  31.4 
 
 		 561 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  31.4 
 
 		 561 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  31.35 
 
 		 549 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  31.13 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.33 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  31.35 
 
 		 549 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>