44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1447 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  313  9e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  51.9 
 
 		 173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  60.99 
 
 		 195 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  53.06 
 
 		 180 aa  166  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  52.26 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  49.66 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  46.81 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  50.35 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  49.67 
 
 		 186 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  45.21 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  48.61 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  48.25 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  37.91 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  37.75 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  39.72 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  43.06 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  40.71 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  37.84 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  42.34 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  35 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  37.06 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  34.31 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  35.66 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  34.03 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  36.11 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  33.56 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  36.3 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  34.13 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5656  hypothetical protein  42.22 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  28.91 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  30.6 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  32.56 
 
 		 315 aa  47.8  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  31.78 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  30.67 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.85 
 
 		 294 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  28.99 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3688  hypothetical protein  38.57 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.41 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3788  hypothetical protein  30.7 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>