19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5656 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5656  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  44.57 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  40.22 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  42.22 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  39.77 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  41.38 
 
 
170 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  40.48 
 
 
153 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  30.61 
 
 
195 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  38.04 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  30.77 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  39.53 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  39.24 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  32.67 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  37 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  36.78 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  35.63 
 
 
151 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  34.57 
 
 
165 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  35.11 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>