More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0588 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
244 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  60.91 
 
 
227 aa  281  9e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  58.37 
 
 
222 aa  265  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  58.82 
 
 
224 aa  263  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  49.79 
 
 
246 aa  241  9e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  50.66 
 
 
234 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  51.3 
 
 
234 aa  215  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  49.55 
 
 
229 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  49.09 
 
 
238 aa  201  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  43.69 
 
 
232 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  39.11 
 
 
226 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  40 
 
 
228 aa  148  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
226 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  38.74 
 
 
227 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 
228 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 
441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
226 aa  132  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  36.07 
 
 
242 aa  128  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
226 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
222 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  33.04 
 
 
228 aa  122  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
233 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  35.04 
 
 
422 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  36.28 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
458 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.7 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  30.8 
 
 
227 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  38.01 
 
 
236 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
230 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  32.05 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.42 
 
 
234 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  30.84 
 
 
234 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.25 
 
 
227 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  31.25 
 
 
225 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
235 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  31.25 
 
 
228 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.2 
 
 
264 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
232 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
244 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  34.89 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
227 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.33 
 
 
229 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  30.47 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
435 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  30.64 
 
 
230 aa  95.9  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
242 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.76 
 
 
375 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
229 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
245 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
374 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  28.63 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  27.57 
 
 
360 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12329  predicted protein  27.98 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  42.31 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.04 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
348 aa  62  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  26.2 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21170  glycosyl transferase  41.84 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
345 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
365 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
348 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  29.63 
 
 
321 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
525 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
389 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
237 aa  55.5  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 
321 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
388 aa  55.5  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
284 aa  55.1  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
235 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
322 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0511  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.01 
 
 
518 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0419  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.37 
 
 
518 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  39.77 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4812  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
514 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.43 
 
 
1157 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0489  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
514 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0423  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.57 
 
 
518 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.91 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  37.35 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
568 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>