78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2555 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  100 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  38.57 
 
 
235 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  42.86 
 
 
235 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  42.86 
 
 
235 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  38.22 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  41.67 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  35.37 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  35.37 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  41.71 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  42.26 
 
 
234 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  39.29 
 
 
225 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  39.29 
 
 
225 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  39.29 
 
 
225 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  39.29 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  39.29 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  39.29 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  37.93 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  39.29 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  38.69 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  44.09 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  36.9 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  35.29 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  38.55 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  34.81 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  33.5 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  34.39 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  35.5 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  33.14 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  36.09 
 
 
276 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  38.1 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  36.14 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  36.14 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1742  purine phosphorylases family protein 1  31 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  35.5 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  42.86 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  40.95 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  32.96 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  33.85 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  34.15 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  32.42 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  34.16 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  32.21 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  35.19 
 
 
247 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  34.91 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  32.49 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  30.32 
 
 
260 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  30.81 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17250  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.21 
 
 
232 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  26.36 
 
 
286 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0602  methylthioadenosine nucleosidase  31.19 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.23 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.62 
 
 
458 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  34.81 
 
 
208 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  26.29 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0302  purine phosphorylases family protein 1  31.06 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0124771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  30.1 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1076  Nucleoside phosphorylase  28.84 
 
 
237 aa  47  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11070  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.33 
 
 
242 aa  46.2  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0308567  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.97 
 
 
227 aa  45.8  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1216  hypothetical protein  28.46 
 
 
230 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.057912  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0828  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.74 
 
 
233 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1392  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.73 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.285892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.47 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.47 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  25.32 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0698  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.9 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.53 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0220  MTA/SAH nucleosidase  28.82 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  34.16 
 
 
657 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  34.9 
 
 
497 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.23 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2915  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.9 
 
 
233 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.23 
 
 
459 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.23 
 
 
459 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14421  nucleoside phosphorylase  43.75 
 
 
272 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>