82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1540 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 287 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  33.7 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  34.81 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  28.78 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  33.82 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  36.69 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  28.57 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  34.89 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.14 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  30.56 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.85 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  33.1 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  31.21 
 
 		 312 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  30.74 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.18 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  36.94 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.46 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.49 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.67 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.48 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  33.67 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.08 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  30.52 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  28.57 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.32 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  27.27 
 
 		 414 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  25.12 
 
 		 410 aa  96.3  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  24.6 
 
 		 311 aa  94  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.73 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.92 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  24 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.41 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  24 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.27 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.27 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.41 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.27 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.27 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  22.16 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  22.99 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  22.16 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  20.64 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  23.64 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  20.24 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  20.57 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  22.59 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  21.23 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1250  hypothetical protein  20 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  21.71 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0970  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  20.89 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2950  HhH-GPD family protein  21.76 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296829  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1032  transcriptional regulator, AraC family  20.89 
 
 		 513 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  22.7 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.07 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  19.41 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4322  alcohol dehydrogenase  20 
 
 		 495 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0948  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  20.86 
 
 		 477 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1029  transcriptional regulator, AraC family  22.15 
 
 		 513 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.86 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3550  alcohol dehydrogenase  20.25 
 
 		 485 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  23.5 
 
 		 302 aa  45.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  22.15 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  21.32 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  21.08 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3944  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  17.83 
 
 		 517 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445653  hitchhiker  0.00805865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  23.19 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  26.43 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3870  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  17.83 
 
 		 517 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  24.65 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  21.35 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3856  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  17.83 
 
 		 496 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26438  hitchhiker  0.00733732 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  22.99 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  22.67 
 
 		 223 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.46 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  24.46 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  24.46 
 
 		 213 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  24.46 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4073  AraC family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 505 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  22.5 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>