53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1273 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  41.98 
 
 		 270 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  49.23 
 
 		 454 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  43.16 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  46.32 
 
 		 239 aa  96.3  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  42.22 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  39.18 
 
 		 623 aa  89.7  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1204  hypothetical protein  35.77 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  42.05 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  32.77 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  27.51 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  36.09 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  41.67 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  32.63 
 
 		 771 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0345  hypothetical protein  36.49 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0343  hypothetical protein  70.73 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0344  hypothetical protein  38.05 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0533  hypothetical protein  39.13 
 
 		 185 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.528363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  35.62 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1142  blue (type1) copper domain-containing protein  34.26 
 
 		 153 aa  53.1  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.036139 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.62 
 
 		 85 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  35.62 
 
 		 157 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  31.94 
 
 		 444 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  33.71 
 
 		 97 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  38.36 
 
 		 114 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.18 
 
 		 111 aa  49.3  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  36.67 
 
 		 112 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  31.73 
 
 		 545 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  37.84 
 
 		 116 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  36.49 
 
 		 110 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3225  cell surface lipoprotein  26.53 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00779237  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  37.31 
 
 		 174 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  42.37 
 
 		 456 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  34.18 
 
 		 140 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  32.43 
 
 		 109 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  33.78 
 
 		 114 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  28.42 
 
 		 112 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  30.12 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  31.58 
 
 		 136 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  33.78 
 
 		 114 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  32.39 
 
 		 123 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  37.31 
 
 		 72 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  30.56 
 
 		 112 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  30.56 
 
 		 112 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  30.56 
 
 		 113 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  35.29 
 
 		 127 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  30.26 
 
 		 116 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.78 
 
 		 749 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 		 120 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  30.56 
 
 		 113 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.25 
 
 		 417 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  28 
 
 		 104 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>