More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0658 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  100 
 
 
410 aa  780    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  73.41 
 
 
361 aa  346  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  61.25 
 
 
234 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1291  GrpE protein  58.65 
 
 
218 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2845  GrpE protein  53.37 
 
 
219 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198977  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 
191 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  42.36 
 
 
208 aa  99.8  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.42 
 
 
194 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 
208 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  34.9 
 
 
213 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  36.08 
 
 
226 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  38.27 
 
 
213 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  35 
 
 
225 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  34.64 
 
 
181 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  34.51 
 
 
209 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.19 
 
 
282 aa  89.4  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  38.22 
 
 
187 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  32 
 
 
194 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 
195 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.46 
 
 
243 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.69 
 
 
204 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  36.36 
 
 
231 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  37.24 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  36.3 
 
 
180 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.08 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  35.43 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  39.58 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 
182 aa  84  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  38.61 
 
 
169 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  33.08 
 
 
173 aa  82.8  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  32.52 
 
 
180 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  37.58 
 
 
207 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 
189 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  37.68 
 
 
178 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  34.51 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  31.72 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  33.33 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.77 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  30.77 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  31.76 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  31.97 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  31.06 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  30.9 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  31.54 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.53 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  33.33 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  32.69 
 
 
217 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 
215 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  31.34 
 
 
202 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  31.72 
 
 
208 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  31.11 
 
 
188 aa  78.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  32.67 
 
 
226 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 
181 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  34.72 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 
181 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  30.3 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 
181 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  32.21 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.89 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  35.25 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  36.94 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 
181 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  31.39 
 
 
194 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  34 
 
 
186 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  30.43 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  36.36 
 
 
218 aa  77  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 
181 aa  77  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  34 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  31.82 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  30.43 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  30.77 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  31.2 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  34.18 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  31.13 
 
 
187 aa  75.5  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.29 
 
 
207 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  34.97 
 
 
210 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  32.85 
 
 
179 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  29.45 
 
 
267 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  33.08 
 
 
187 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1359  GrpE protein  34.06 
 
 
181 aa  75.1  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
188 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  34.04 
 
 
208 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  33.58 
 
 
179 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  29.86 
 
 
189 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  33.12 
 
 
172 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  33.97 
 
 
181 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  30.77 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  33.33 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  31.43 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  31.62 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>