46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4407 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  55.56 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  57.42 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  53.05 
 
 		 212 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  51.64 
 
 		 212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  57.41 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  51.17 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  35.68 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  37.09 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  38.03 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  35.98 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  35.68 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  35.21 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  33.02 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  37.56 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  37.09 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  27.7 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  34.74 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  31.92 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  31.46 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  33.49 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  32.41 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  32.55 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  37.38 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  33.8 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  31.53 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  34.27 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  36.15 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  33.18 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  28.29 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  32.88 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  31.25 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0046  hypothetical protein  76.19 
 
 		 81 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  30.88 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  32.86 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  33.68 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  30.8 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  30.41 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  28.31 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0047  hypothetical protein  38.55 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  36.96 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  25.11 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  31.75 
 
 		 128 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1554  hypothetical protein  40.28 
 
 		 85 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  29.91 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>