More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3413 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 325 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  93.23 
 
 		 325 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  85.54 
 
 		 337 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  82.15 
 
 		 336 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  82.15 
 
 		 336 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  79.08 
 
 		 337 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  69.47 
 
 		 333 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  61.13 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  58.13 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  57.32 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  57.32 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  57.1 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  59.29 
 
 		 331 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  56.88 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  57.46 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  53.68 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  57.94 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  54.37 
 
 		 333 aa  358  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  56.51 
 
 		 340 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  56.88 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  56.7 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  55.87 
 
 		 340 aa  351  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  56.07 
 
 		 331 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  56.23 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  55 
 
 		 331 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  53.12 
 
 		 322 aa  330  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  54.13 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  53.97 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  54.42 
 
 		 340 aa  315  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  55.7 
 
 		 366 aa  315  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  54.24 
 
 		 353 aa  312  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  54.23 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  51.52 
 
 		 321 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  52.62 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  52.31 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  51.68 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  53.12 
 
 		 326 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  52.31 
 
 		 324 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  52.72 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  52.81 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  53.04 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.61 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  52 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  51.23 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  50.31 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  46.69 
 
 		 319 aa  292  5e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  50.47 
 
 		 327 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  47.47 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  47.47 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  52.2 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  50.94 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  50.94 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  50.46 
 
 		 324 aa  288  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  49.83 
 
 		 324 aa  288  8e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  50 
 
 		 324 aa  288  8e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  49.38 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  51.41 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  49.38 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  48.6 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  49.69 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  49.69 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.42 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  48.61 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.61 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.8 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  51.83 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  47.81 
 
 		 323 aa  275  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.67 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  48.14 
 
 		 320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  44.34 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  48.93 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  48.31 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  47.85 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  44.75 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  47.06 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  47.98 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.67 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  46.6 
 
 		 333 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  47.5 
 
 		 331 aa  271  9e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  48.15 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  48.46 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.54 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  46.54 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.54 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.54 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.54 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.54 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  48.01 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.54 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  46.54 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.86 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>