More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2965 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2152  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  46.56 
 
 		 801 aa  734    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.57135  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1000  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  53.69 
 
 		 816 aa  874    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2919  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.61 
 
 		 814 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1990  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  47.27 
 
 		 801 aa  749    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0592  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  61.26 
 
 		 820 aa  1014    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1114  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.7 
 
 		 812 aa  1004    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2849  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.05 
 
 		 820 aa  906    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3528  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.18 
 
 		 820 aa  907    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2293  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  46.78 
 
 		 801 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1997  nitrite reductase  47.5 
 
 		 801 aa  741    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00110354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1970  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  47.75 
 
 		 801 aa  744    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.473081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1949  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  47.75 
 
 		 801 aa  741    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0412209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3130  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.61 
 
 		 814 aa  877    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2956  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.71 
 
 		 818 aa  933    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0208  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  48.31 
 
 		 801 aa  755    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0816  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  57.04 
 
 		 814 aa  925    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359061  normal  0.0137371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0668  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  62.87 
 
 		 826 aa  1020    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2309  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  55.51 
 
 		 818 aa  894    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0719  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  57.39 
 
 		 820 aa  903    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.825422  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0099  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.61 
 
 		 814 aa  877    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0741  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.61 
 
 		 814 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1781  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  54.26 
 
 		 823 aa  880    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1407  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  54.18 
 
 		 815 aa  859    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2472  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.82 
 
 		 801 aa  746    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2245  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.69 
 
 		 837 aa  659    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.240706 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2146  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  47.5 
 
 		 801 aa  741    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0558  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.14 
 
 		 814 aa  877    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1490  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.61 
 
 		 814 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1142  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.72 
 
 		 825 aa  902    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.861226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0464  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.74 
 
 		 814 aa  875    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3162  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  47.25 
 
 		 801 aa  738    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00213461  normal  0.298002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2096  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  55.5 
 
 		 818 aa  908    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115121 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4525  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.97 
 
 		 820 aa  949    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.927735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2968  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  60.89 
 
 		 831 aa  994    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3043  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  54.18 
 
 		 811 aa  858    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2557  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  54.06 
 
 		 823 aa  877    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1707  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  61.63 
 
 		 839 aa  1010    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3276  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  54.43 
 
 		 810 aa  872    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2424  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.82 
 
 		 801 aa  746    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2839  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  55.62 
 
 		 821 aa  859    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.184658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1629  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.9 
 
 		 816 aa  939    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.899619  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2965  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  100 
 
 		 817 aa  1675    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5894  nitrite reductase large subunit  57.58 
 
 		 815 aa  968    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  51.62 
 
 		 808 aa  812    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1266  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  61.86 
 
 		 825 aa  1007    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0963412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  54.12 
 
 		 821 aa  866    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2107  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  54.84 
 
 		 823 aa  853    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.614083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.4 
 
 		 816 aa  941    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116537  normal  0.910407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.23 
 
 		 814 aa  908    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1990  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.61 
 
 		 800 aa  743    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1700  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  59.75 
 
 		 811 aa  986    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.575793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1667  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.01 
 
 		 810 aa  864    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0751233  normal  0.158912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1080  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.24 
 
 		 814 aa  926    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.406718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41530  assimilatory nitrite reductase large subunit  55.38 
 
 		 816 aa  896    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23370  Assimilatory Nitrite reductase,large subunit; NasA  54.39 
 
 		 816 aa  861    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2317  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  54.42 
 
 		 819 aa  872    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.551763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2593  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  52.14 
 
 		 825 aa  839    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.5 
 
 		 821 aa  858    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.58 
 
 		 810 aa  872    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0573  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.49 
 
 		 814 aa  872    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2177  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  47.63 
 
 		 801 aa  742    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3525  assimilatory nitrite reductase large subunit  54.88 
 
 		 816 aa  887    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0397  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.5 
 
 		 834 aa  632  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.77 
 
 		 822 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742948  normal  0.535106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3231  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  44.46 
 
 		 819 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3293  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.46 
 
 		 819 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3242  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.21 
 
 		 819 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.21 
 
 		 870 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0740855  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3053  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.61 
 
 		 827 aa  617  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.050716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3013  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.83 
 
 		 823 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1392  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  42.63 
 
 		 839 aa  607  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3774  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  41.36 
 
 		 813 aa  602  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.541337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3275  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.44 
 
 		 846 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1332  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  37.21 
 
 		 837 aa  509  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0149274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  37.33 
 
 		 971 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3956  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  37.02 
 
 		 848 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0235  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.9 
 
 		 848 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4046  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.52 
 
 		 850 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.23 
 
 		 850 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3793  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.52 
 
 		 847 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0249011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2384  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.4 
 
 		 830 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312411  normal  0.440122 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.51 
 
 		 1373 aa  485  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2322  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor / assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit / assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  38.64 
 
 		 1328 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05591  nitrate reductase  36.91 
 
 		 839 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03216  nitrite reductase, large subunit, NAD(P)H-binding  37.67 
 
 		 847 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0347  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.67 
 
 		 847 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0347  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.79 
 
 		 847 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3647  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  37.79 
 
 		 847 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3779  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  37.47 
 
 		 847 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3671  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  37.44 
 
 		 847 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4676  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  37.79 
 
 		 847 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.54103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3741  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  37.79 
 
 		 847 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1441  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.67 
 
 		 1386 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5406  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.96 
 
 		 837 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3835  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  37.79 
 
 		 847 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3561  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  37.67 
 
 		 847 aa  479  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2058  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.83 
 
 		 823 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3671  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  37.35 
 
 		 847 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3744  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  37.35 
 
 		 847 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.23042  normal  0.171499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3842  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  37.35 
 
 		 847 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>