45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2668 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  82.84 
 
 		 270 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  62.84 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  66.67 
 
 		 267 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  63.22 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  64.66 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  62.35 
 
 		 261 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  42.17 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  39.67 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  37.77 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  40.42 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  47.65 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  34.3 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  32.13 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  35.94 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  29.75 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  34.88 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  31.9 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  36.64 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  34.25 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  33.81 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  32.27 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  37.5 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  37.5 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  31.36 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  37.75 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  29.41 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  33.08 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  33.99 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  31.38 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  36.9 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  32.63 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  35.05 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  30.04 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  29.35 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  34.83 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  32.32 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  31.82 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  32.73 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  28.21 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  29.26 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  35.56 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  31.32 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  34.01 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  30.6 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>