More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5061 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
185 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  84.32 
 
 
183 aa  328  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  77.3 
 
 
194 aa  308  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  82.74 
 
 
171 aa  302  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  82.53 
 
 
171 aa  297  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  82.91 
 
 
217 aa  282  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  72.19 
 
 
188 aa  279  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  82.28 
 
 
211 aa  279  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  78.26 
 
 
187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.22 
 
 
214 aa  266  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  76.22 
 
 
196 aa  265  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  71.26 
 
 
199 aa  263  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  72.19 
 
 
185 aa  262  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  75 
 
 
211 aa  261  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  71.6 
 
 
211 aa  258  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  71.6 
 
 
211 aa  258  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  70.52 
 
 
174 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.1 
 
 
175 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  70.52 
 
 
174 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  72.22 
 
 
175 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  73.46 
 
 
174 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  75.32 
 
 
203 aa  251  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.25 
 
 
254 aa  249  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  71.6 
 
 
174 aa  249  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.6 
 
 
247 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  65.91 
 
 
218 aa  242  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  72.9 
 
 
167 aa  241  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  68.71 
 
 
252 aa  234  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  64.85 
 
 
226 aa  228  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  65.66 
 
 
300 aa  227  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.63 
 
 
165 aa  160  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.56 
 
 
229 aa  159  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.63 
 
 
165 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.02 
 
 
168 aa  158  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.86 
 
 
179 aa  157  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  52.67 
 
 
177 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.15 
 
 
177 aa  147  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.15 
 
 
199 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.93 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  47.29 
 
 
176 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.85 
 
 
169 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  46.51 
 
 
184 aa  121  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  47.66 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.93 
 
 
181 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  43.94 
 
 
162 aa  117  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  44.12 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  42.22 
 
 
175 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.04 
 
 
132 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.04 
 
 
132 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.51 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.51 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.96 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  46.21 
 
 
132 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.75 
 
 
135 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.04 
 
 
171 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  48.78 
 
 
164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
163 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
163 aa  111  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  41.1 
 
 
182 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
176 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.7 
 
 
131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  40.3 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  38.81 
 
 
171 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
162 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  40.41 
 
 
182 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  39.1 
 
 
171 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  39.69 
 
 
176 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.6 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  39.55 
 
 
167 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
163 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  39.55 
 
 
167 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  39.57 
 
 
163 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
176 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 
162 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  39.73 
 
 
182 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.79 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
163 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>