151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4918 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4918  globin  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  44.29 
 
 
177 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.92 
 
 
407 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.29 
 
 
367 aa  85.1  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  37.01 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.91 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  30.3 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  30.3 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  32.82 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  32.09 
 
 
403 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  34.11 
 
 
127 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.45 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  33.08 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  29.1 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.11 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.6 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.23 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 
838 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  34.51 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  27.61 
 
 
144 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  32.41 
 
 
141 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  32.09 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  32.58 
 
 
390 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.82 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  30.97 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.51 
 
 
371 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  28.1 
 
 
411 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  33.65 
 
 
396 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.48 
 
 
383 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  29.41 
 
 
135 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  30.3 
 
 
393 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  27.2 
 
 
141 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
402 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  28.39 
 
 
392 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  31.43 
 
 
413 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  30.94 
 
 
411 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  28.39 
 
 
392 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  30.71 
 
 
414 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  28.39 
 
 
392 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  28.39 
 
 
392 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  30.91 
 
 
393 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.03 
 
 
393 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  28.48 
 
 
393 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  32.38 
 
 
402 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  32.38 
 
 
402 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  32.38 
 
 
402 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  32.38 
 
 
402 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  32.38 
 
 
402 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  32.38 
 
 
402 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  32.38 
 
 
402 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  32.38 
 
 
402 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  31.43 
 
 
402 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  27.2 
 
 
137 aa  58.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  28.57 
 
 
142 aa  58.2  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  31.03 
 
 
409 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  28.79 
 
 
393 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  27.07 
 
 
152 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  30.83 
 
 
397 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  26.83 
 
 
396 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  31.43 
 
 
402 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  30.83 
 
 
397 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  26.35 
 
 
408 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  29.29 
 
 
414 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  31.61 
 
 
393 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  28.39 
 
 
393 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  30.71 
 
 
149 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  30.53 
 
 
139 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32831  hypothetical protein  22.65 
 
 
348 aa  55.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168677  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.45 
 
 
380 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.37 
 
 
402 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  29.32 
 
 
393 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  27.21 
 
 
401 aa  54.3  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  30.37 
 
 
140 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  24.05 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  28.26 
 
 
398 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46237  predicted protein  26.28 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  26.95 
 
 
402 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  25.98 
 
 
400 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.66 
 
 
402 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  27.66 
 
 
402 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  27.66 
 
 
402 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  26.19 
 
 
394 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  26.62 
 
 
393 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  26.95 
 
 
402 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.95 
 
 
402 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.01 
 
 
428 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  27.27 
 
 
399 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  26.62 
 
 
393 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  27.13 
 
 
399 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5299  nitric oxide dioxygenase  28.68 
 
 
149 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939746  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  27.91 
 
 
140 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  26.02 
 
 
426 aa  52  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  27.13 
 
 
402 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  27.13 
 
 
402 aa  52  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  27.13 
 
 
402 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  27.13 
 
 
402 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  27.13 
 
 
402 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  27.13 
 
 
402 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.33 
 
 
399 aa  52  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>