182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5299 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5299  nitric oxide dioxygenase  100 
 
 		 149 aa  296  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0148  globin  81.08 
 
 		 148 aa  241  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  66.9 
 
 		 149 aa  199  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  55.7 
 
 		 403 aa  157  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  57.14 
 
 		 402 aa  153  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  54.48 
 
 		 411 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  55.17 
 
 		 414 aa  151  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  59.23 
 
 		 409 aa  150  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  52.74 
 
 		 403 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  53.9 
 
 		 403 aa  150  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  53.1 
 
 		 414 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  53.38 
 
 		 397 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  53.38 
 
 		 397 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  53.52 
 
 		 413 aa  143  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  50.71 
 
 		 409 aa  142  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  52.86 
 
 		 393 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  52.86 
 
 		 408 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  48.63 
 
 		 393 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  52.14 
 
 		 393 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  50 
 
 		 393 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.36 
 
 		 393 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  49.29 
 
 		 393 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  50.71 
 
 		 393 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  49.66 
 
 		 394 aa  133  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  53.52 
 
 		 423 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  53.52 
 
 		 414 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  48.57 
 
 		 392 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  48.57 
 
 		 392 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  55.91 
 
 		 393 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  47.86 
 
 		 392 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  47.86 
 
 		 393 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  54.23 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0909  nitric oxide dioxygenase  49.66 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357631  normal  0.205289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  47.86 
 
 		 392 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  49.29 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1514  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  54.68 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.156255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.1 
 
 		 399 aa  127  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  50 
 
 		 419 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  49.66 
 
 		 428 aa  124  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  52.14 
 
 		 393 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  43.07 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  42.34 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  46.38 
 
 		 393 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  47.22 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  48.57 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  48.57 
 
 		 402 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  48.57 
 
 		 402 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  48.57 
 
 		 402 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  48.57 
 
 		 402 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  48.57 
 
 		 399 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  48.57 
 
 		 402 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  44.29 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  44.29 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.86 
 
 		 402 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  47.86 
 
 		 402 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  47.86 
 
 		 402 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  47.86 
 
 		 402 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  48.53 
 
 		 402 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.84 
 
 		 406 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  46.43 
 
 		 402 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.43 
 
 		 402 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  44.6 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  44.52 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  42.14 
 
 		 397 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  46.32 
 
 		 402 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  45 
 
 		 402 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  43.75 
 
 		 399 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  39.31 
 
 		 410 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  40.69 
 
 		 400 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  40.58 
 
 		 401 aa  106  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  40.88 
 
 		 397 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  40.88 
 
 		 397 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  40.88 
 
 		 397 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  40.88 
 
 		 397 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  41.67 
 
 		 393 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  42.36 
 
 		 411 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  44.29 
 
 		 395 aa  104  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.22 
 
 		 407 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  43.88 
 
 		 403 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  44.06 
 
 		 402 aa  103  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  44.06 
 
 		 402 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  44.06 
 
 		 402 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  44.06 
 
 		 402 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  44.06 
 
 		 402 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  44.06 
 
 		 402 aa  103  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  44.06 
 
 		 402 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  44.06 
 
 		 402 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1937  flavohemoprotein, truncation  40.58 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  43.36 
 
 		 402 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  44.06 
 
 		 402 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  38.57 
 
 		 396 aa  100  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1574  flavohemoprotein, truncation  41.3 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  44.03 
 
 		 396 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1757  flavohemoprotein, truncation  40.58 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.7 
 
 		 401 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.7 
 
 		 401 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2776  Nitric oxide dioxygenase  42.25 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  42.5 
 
 		 401 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  41.67 
 
 		 402 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  39.31 
 
 		 400 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>