289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2282 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2282  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
114 aa  231  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175309  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  67.27 
 
 
393 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  67.27 
 
 
391 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  66.06 
 
 
402 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.14 
 
 
161 aa  136  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.36 
 
 
128 aa  134  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.79 
 
 
132 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.86 
 
 
154 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.63 
 
 
134 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.46 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.36 
 
 
393 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.36 
 
 
393 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.36 
 
 
393 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.36 
 
 
393 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.36 
 
 
393 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  69.37 
 
 
397 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.16 
 
 
400 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.36 
 
 
132 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.36 
 
 
132 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.68 
 
 
128 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.79 
 
 
128 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.68 
 
 
128 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  52.68 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.68 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.35 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.68 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  53.57 
 
 
131 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.79 
 
 
128 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.79 
 
 
128 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.79 
 
 
128 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.79 
 
 
128 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.68 
 
 
128 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.89 
 
 
128 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.79 
 
 
128 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.79 
 
 
128 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  50 
 
 
373 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.57 
 
 
133 aa  114  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  53.15 
 
 
396 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.35 
 
 
128 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  51.35 
 
 
392 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.35 
 
 
129 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  50 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2692  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.21 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00273056  normal  0.231258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  49.54 
 
 
133 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.34 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  56.88 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.21 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  48.67 
 
 
397 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  47.71 
 
 
133 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.79 
 
 
130 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.79 
 
 
130 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.46 
 
 
140 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.79 
 
 
130 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.71 
 
 
130 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.21 
 
 
134 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  47.75 
 
 
132 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.71 
 
 
125 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.87 
 
 
132 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.71 
 
 
133 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.71 
 
 
123 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  47.79 
 
 
396 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.44 
 
 
127 aa  103  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.95 
 
 
132 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  44.95 
 
 
132 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.54 
 
 
134 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.87 
 
 
130 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  50 
 
 
393 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.64 
 
 
135 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  43.09 
 
 
425 aa  98.6  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  47.27 
 
 
393 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
128 aa  97.1  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.07 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  51.35 
 
 
386 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0559  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.85 
 
 
134 aa  95.9  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0388292  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.79 
 
 
134 aa  95.9  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.96 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.96 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3492  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.24 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196165  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1856  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.98 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.177717  normal  0.121417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.79 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.96 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  44.86 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.79 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
136 aa  94.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  43.12 
 
 
128 aa  93.6  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.44 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  40.91 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  47.66 
 
 
125 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.71 
 
 
127 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  40.91 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  40.91 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1965  carboxymuconolactone decarboxylase  41.07 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0644561  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  40.91 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.66 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  43.12 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.12 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  43.12 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  40.54 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.22 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>