More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1087 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 350 aa  675    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  54.63 
 
 		 348 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  49.57 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  50.88 
 
 		 331 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  48.86 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  49.71 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  45.77 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  47.66 
 
 		 345 aa  265  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  53.64 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  49.56 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  47.97 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  44.12 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  47.74 
 
 		 372 aa  252  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  43.86 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  44.51 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  44 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  44.57 
 
 		 341 aa  232  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  44.59 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  47.21 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  43.7 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  42.82 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  40.97 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  44.61 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  48.8 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  39.37 
 
 		 342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  43.37 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  41.59 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  46.26 
 
 		 357 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  42.3 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  41.31 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  41.09 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  40.74 
 
 		 344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.29 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  40.07 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2584  Alanine racemase  41.88 
 
 		 376 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  34.04 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  38.7 
 
 		 353 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  37.89 
 
 		 333 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  39.48 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  36.73 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  37.95 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.79 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.91 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  39.63 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.76 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  33.12 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  33.12 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.44 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.48 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.55 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  33.12 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  33.12 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  33.12 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  33.12 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.48 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  33.12 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  32.95 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  32.8 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  36.18 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.91 
 
 		 347 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.15 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.61 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.81 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.27 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1004  LacI family response repressor  37.54 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  39.38 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.46 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.64 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.7 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.46 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  36.61 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  36.16 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  32.61 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1403  LacI family response repressor  34.66 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.06 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  35.28 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3453  LacI family transcription regulator  38.78 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.286826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.06 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.06 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.06 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.06 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1464  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  31.5 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1273  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  35.85 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  37.95 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.26 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  37.27 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1537  LacI family response repressor  31.65 
 
 		 385 aa  152  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>