More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4678 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 508 aa  998    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  67.57 
 
 		 484 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  56.24 
 
 		 513 aa  518  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  42.56 
 
 		 516 aa  362  7.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  41.85 
 
 		 506 aa  332  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  41.96 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  38.36 
 
 		 503 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  38.83 
 
 		 494 aa  312  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  38.68 
 
 		 510 aa  312  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  39.43 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  37.09 
 
 		 553 aa  310  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  36.31 
 
 		 516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  36.98 
 
 		 517 aa  276  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  36.08 
 
 		 507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  35.91 
 
 		 511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  33.89 
 
 		 535 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  33.68 
 
 		 535 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  33.97 
 
 		 513 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 512 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 		 517 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  33.89 
 
 		 524 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 485 aa  170  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 		 456 aa  163  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  29.63 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  29.66 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 449 aa  93.2  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  27.15 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.86 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.14 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.88 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.8 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  26.1 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  23.52 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 455 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  23.06 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  23.06 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  26.72 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  23.71 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  22.08 
 
 		 465 aa  73.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  22.29 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  22.29 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  22.11 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  22.51 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  21.87 
 
 		 471 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.85 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  22.29 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  22.05 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  24.33 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  23.83 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  22.88 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 440 aa  70.1  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 770 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  22.88 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  22.88 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  24.58 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  23.67 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  24.58 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  24.58 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  25.94 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  24.58 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  23.17 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.02 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>