More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4313 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
507 aa  986    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7204  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like protein  51.08 
 
 
502 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2826  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.05 
 
 
513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.392929  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.41 
 
 
505 aa  435  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26200  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  48.92 
 
 
505 aa  428  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15560  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  47.14 
 
 
506 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.031128  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 
506 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 
506 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.122029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 
510 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348427  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 
336 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.31 
 
 
332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31130  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.34 
 
 
338 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.12 
 
 
327 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  51.02 
 
 
339 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1632  putative ABC transporter permease  46.71 
 
 
336 aa  152  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
325 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.2 
 
 
320 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
322 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161114  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.11 
 
 
331 aa  147  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
325 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
325 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
325 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 
335 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 
321 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.91 
 
 
344 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 
355 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.41 
 
 
321 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  45.81 
 
 
321 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
334 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  45.81 
 
 
321 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 
334 aa  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11309  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppB  41.94 
 
 
325 aa  143  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
325 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497916  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  47.26 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  47.26 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  46.58 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.79 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  47.26 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  47.26 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  47.26 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  47.83 
 
 
339 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  47.83 
 
 
339 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  47.83 
 
 
339 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
326 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  47.83 
 
 
339 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  47.83 
 
 
339 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  47.83 
 
 
339 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  47.83 
 
 
339 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  47.83 
 
 
339 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  47.83 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  45.89 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  45.89 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
320 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5912  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.39 
 
 
339 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.43 
 
 
318 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  46.43 
 
 
307 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  46.43 
 
 
318 aa  140  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  46.43 
 
 
318 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
319 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 
318 aa  140  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.43 
 
 
307 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  47.45 
 
 
339 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.86 
 
 
325 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  47.45 
 
 
339 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  46.43 
 
 
317 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000495045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
324 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  44.52 
 
 
339 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.59 
 
 
336 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 
338 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  47.95 
 
 
336 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.95 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.28 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  48.91 
 
 
324 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  45.21 
 
 
339 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
308 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  45.52 
 
 
351 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.2 
 
 
326 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5137  putative peptide ABC transporter protein, permease protein  42.41 
 
 
339 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0417349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
333 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
327 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 
327 aa  136  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.93 
 
 
307 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
334 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.93 
 
 
318 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.95 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.236765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
327 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  45.19 
 
 
318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.21 
 
 
331 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  48.15 
 
 
337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.86 
 
 
306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 
323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.259028  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.48 
 
 
335 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  48.15 
 
 
334 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  49.62 
 
 
336 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>