68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3841 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 343 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  62.9 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  62.82 
 
 		 327 aa  381  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  62.1 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  59.55 
 
 		 328 aa  358  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  58.17 
 
 		 331 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  57.59 
 
 		 325 aa  341  8e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  59.35 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  54.66 
 
 		 294 aa  322  7e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  54.49 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.66 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.33 
 
 		 308 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.21 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47 
 
 		 311 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.91 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.73 
 
 		 250 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.8 
 
 		 236 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.01 
 
 		 237 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.67 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.77 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.52 
 
 		 233 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.69 
 
 		 244 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.67 
 
 		 256 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.12 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.07 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.46 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  31.25 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.92 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.23 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  30.23 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  30.23 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.51 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  38.97 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.05 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  28.42 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  25.22 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.75 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.55 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.59 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281874 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.01 
 
 		 220 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  30.77 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.34 
 
 		 191 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  32.53 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.71 
 
 		 190 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.19 
 
 		 216 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.49 
 
 		 247 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  27.23 
 
 		 377 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.35 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.35 
 
 		 258 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  37.5 
 
 		 283 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  25.7 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  43.06 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.44 
 
 		 192 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  30.19 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  27.81 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.82 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.18 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  24.48 
 
 		 190 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.25 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.58 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.13 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.82 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>