More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3510 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3510  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 340 aa  668    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0130099  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3511  transcriptional regulator, LacI family  60.47 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0677107  normal  0.351268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3343  LacI family transcription regulator  52.99 
 
 		 349 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716413  normal  0.0750883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  53.75 
 
 		 349 aa  322  5e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11580  transcriptional regulator, LacI family  53.15 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3351  LacI family transcription regulator  52.11 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  decreased coverage  0.0034898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0746  LacI family transcription regulator  52.4 
 
 		 360 aa  317  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1882  LacI family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.711539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5892  transcriptional regulator, LacI family  54.19 
 
 		 332 aa  312  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0802  alanine racemase  51.73 
 
 		 368 aa  311  7.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  51.52 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2112  transcriptional regulator, LacI family  51.8 
 
 		 350 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  49.27 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13850  transcriptional regulator, LacI family  49.25 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1131  transcriptional regulator, LacI family  50.61 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2163  transcriptional regulator, LacI family  50.74 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0696  transcriptional regulator, LacI family  48.95 
 
 		 357 aa  292  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.477401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1780  transcriptional regulator, LacI family  48.5 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5857  transcriptional regulator, LacI family  45.59 
 
 		 338 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.55822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27370  transcriptional regulator, LacI family  46.75 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316556  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6898  LacI family transcription regulator  46.87 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8463  transcriptional regulator, LacI family  45.62 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3704  transcriptional regulator, LacI family  44.94 
 
 		 353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0061  transcriptional regulator, LacI family  45.43 
 
 		 341 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5410  LacI family transcription regulator  44.48 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3766  LacI family transcription regulator  45.62 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03820  transcriptional regulator, LacI family  44.34 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.048726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3705  transcriptional regulator, LacI family  42.52 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0259788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12300  transcriptional regulator  42.77 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.194881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0937  ribose operon repressor RbsR  38.3 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0347  transcriptional regulator, LacI family  38.12 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.08 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  34.03 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.88 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  34.14 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  34.72 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  33.23 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  29.76 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.43 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.23 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.52 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.85 
 
 		 335 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.18 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.18 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.85 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.46 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  29.04 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  27.16 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  31.34 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  31.42 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.41 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  32.07 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  28.7 
 
 		 352 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.14 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.82 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  27.58 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  31.53 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  32.37 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.82 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.33 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  30.88 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  26.2 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.08 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.36 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  29.38 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.83 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  29.38 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.38 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  29.25 
 
 		 337 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  32.53 
 
 		 342 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>