65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2399 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  43.63 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  41.51 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  38.5 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  43.12 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  39.25 
 
 		 239 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  36.1 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  40.78 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  38.39 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  29.9 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 288 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  38.38 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  43.14 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 128 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  45.1 
 
 		 151 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  45.1 
 
 		 151 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  25.98 
 
 		 142 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.14 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  43.14 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 137 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 122 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 143 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 147 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 297 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 143 aa  42  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 147 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 147 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  37.65 
 
 		 146 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 137 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  43.14 
 
 		 152 aa  41.6  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 132 aa  41.6  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  41.6  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 132 aa  41.6  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 		 135 aa  41.6  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  41.2  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  36.11 
 
 		 116 aa  41.2  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  20.93 
 
 		 129 aa  41.2  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>