More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0783 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 484 aa  948    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  59.07 
 
 		 452 aa  441  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  51.77 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  54.84 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  49.43 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  51.02 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  48.54 
 
 		 518 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  49.1 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  53.4 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  49 
 
 		 478 aa  360  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  52.04 
 
 		 482 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  52.77 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  48.13 
 
 		 487 aa  346  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  51.69 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  54.25 
 
 		 414 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  54.28 
 
 		 414 aa  339  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  48.79 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  49.66 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  49.32 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  49.2 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  31.48 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  31.02 
 
 		 428 aa  240  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  31.84 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  33.18 
 
 		 485 aa  221  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  34.8 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  34.33 
 
 		 470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  33.95 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  35.29 
 
 		 879 aa  203  7e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.11 
 
 		 415 aa  197  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.08 
 
 		 413 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.18 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.65 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  32.05 
 
 		 416 aa  190  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.63 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.89 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.28 
 
 		 416 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.76 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.95 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.71 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.14 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.31 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.41 
 
 		 641 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.08 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  31.82 
 
 		 413 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.55 
 
 		 414 aa  183  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35 
 
 		 433 aa  183  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  32.65 
 
 		 393 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.71 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.77 
 
 		 406 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  35.62 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  32.9 
 
 		 501 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  28.09 
 
 		 420 aa  182  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.31 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  31.83 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  32.82 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.05 
 
 		 403 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.07 
 
 		 408 aa  181  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.38 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.63 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  32.3 
 
 		 408 aa  179  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  37.34 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.71 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  29.44 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.95 
 
 		 604 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.15 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.95 
 
 		 604 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.89 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.84 
 
 		 657 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.09 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  31.23 
 
 		 420 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.26 
 
 		 413 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 409 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.12 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.65 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.23 
 
 		 429 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  32.9 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.26 
 
 		 412 aa  176  7e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  30.56 
 
 		 405 aa  176  9e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 409 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.29 
 
 		 406 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.62 
 
 		 415 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  30.3 
 
 		 405 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  35.46 
 
 		 878 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.56 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.43 
 
 		 415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.66 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.23 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3698  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.17 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.81 
 
 		 608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.66 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.59 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  32.41 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.05 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.86 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.26 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.05 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  31.98 
 
 		 404 aa  174  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3507  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.92 
 
 		 445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  31.98 
 
 		 406 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  34.78 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>