More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0283 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0283  ribosomal protein S5  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  45.28 
 
 		 201 aa  147  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_002978  WD0664  30S ribosomal protein S5  48.19 
 
 		 170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0314639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  44.91 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  45.4 
 
 		 201 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0595  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 174 aa  144  9e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0331863  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  45.91 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0426  30S ribosomal protein S5  48.72 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.712709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  45.28 
 
 		 187 aa  141  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  45.06 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  43.37 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  45.7 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  46.84 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  48.05 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  42.6 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  44.3 
 
 		 192 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  44.03 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  48.65 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  48.65 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  45.81 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  45.28 
 
 		 195 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  43.75 
 
 		 191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  44.65 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  44.65 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  43.75 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  43.75 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  43.75 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  44.65 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  44.65 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  43.67 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  43.48 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  43.37 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  42.68 
 
 		 199 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2801  30S ribosomal protein S5  46.25 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  41.76 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  40.51 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  42.77 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  44.3 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  42.68 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  43.37 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0475  30S ribosomal protein S5  43.98 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  43.98 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  43.98 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  43.98 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  43.98 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  43.98 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  43.98 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1266  30S ribosomal protein S5  45 
 
 		 237 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0807868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  43.98 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1336  30S ribosomal protein S5  43.03 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  43.12 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  43.98 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  43.98 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  44.08 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1732  30S ribosomal protein S5  42.77 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0378  30S ribosomal protein S5  42.77 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  44.3 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  43.67 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  43.67 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  42.14 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  42.14 
 
 		 189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  42.42 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  42.86 
 
 		 189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  40.96 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  38.61 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  42.42 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  41.67 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  42.14 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  41.67 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  39.24 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  42.86 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  41.67 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  42.77 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  41.67 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  41.67 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0337  30S ribosomal protein S5  43.04 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00106169  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  48.18 
 
 		 206 aa  124  5e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  41.61 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  40.12 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  40.49 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2157  30S ribosomal protein S5  44.3 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232198  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0345  ribosomal protein S5  41.25 
 
 		 167 aa  124  9e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 		 168 aa  124  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  40.74 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  39.24 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  40.36 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0514  30S ribosomal protein S5  41.83 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0137335  unclonable  0.0000000000177209 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  48.59 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  41.83 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  44.16 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0841  30S ribosomal protein S5  43.48 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  44.87 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  41.14 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  43.04 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  42.5 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  41.14 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0336  30S ribosomal protein S5  39.49 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000198476  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  40.48 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  40.48 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>