87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_15431 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_15431  putative pfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 
280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.345352  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0709  putative pfkB family carbohydrate kinase  98.57 
 
 
280 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.19808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12381  putative pfkB family carbohydrate kinase  54.29 
 
 
283 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1746  pfkB family carbohydrate kinase  52.59 
 
 
288 aa  296  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1813  pfkB family carbohydrate kinase  48.75 
 
 
309 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11481  putative pfkB family carbohydrate kinase  50 
 
 
280 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.036183  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11501  putative pfkB family carbohydrate kinase  47.94 
 
 
289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.605527  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1055  PfkB family carbohydrate kinase  48.31 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.18758  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11491  putative pfkB family carbohydrate kinase  48.31 
 
 
289 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0717159  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11351  putative pfkB family carbohydrate kinase  48.69 
 
 
289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0498  carbohydrate kinase, PfkB  38.4 
 
 
285 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0531  PfkB domain protein  37.26 
 
 
285 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0526  PfkB domain protein  37.26 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1085  PfkB domain protein  39.39 
 
 
295 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2912  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.140234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  25.25 
 
 
313 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.74 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  23.29 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  23.45 
 
 
324 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  24.31 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  21.36 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  23.08 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  22.87 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  26.39 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  23.99 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  27.27 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  23.79 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  25.36 
 
 
303 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  24.31 
 
 
309 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  23.11 
 
 
310 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  24.55 
 
 
305 aa  48.9  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  24.73 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  23.4 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  23.15 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  22.22 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  23.48 
 
 
302 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  25.36 
 
 
307 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  21.69 
 
 
302 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  25.09 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  37.84 
 
 
320 aa  47  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  21.53 
 
 
304 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  24.64 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  22.06 
 
 
295 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  23.22 
 
 
299 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  24.64 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  23.83 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  23.58 
 
 
280 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  22.58 
 
 
282 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  29.41 
 
 
331 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  23.62 
 
 
261 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  21.76 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.22 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  22.18 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  31.19 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  23.28 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  29.63 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  39.44 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  22.34 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0576  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  25.71 
 
 
475 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  23.79 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  21.55 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  23.61 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  27.16 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  30.56 
 
 
353 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  25.45 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  22.65 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2407  rfaE bifunctional protein  24.15 
 
 
326 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  28.77 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  23.13 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  21.3 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  21.6 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  24.02 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  24.02 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  24.02 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  24.02 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  31.78 
 
 
314 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  30.56 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  23.1 
 
 
360 aa  42.7  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  34.25 
 
 
319 aa  42.7  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  31.25 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  26.83 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  19.77 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  23.62 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  21.7 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  23.31 
 
 
332 aa  42.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  27.72 
 
 
302 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  35.62 
 
 
319 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>