More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4522 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2175  acyl-CoA synthetase  87.08 
 
 
472 aa  769    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114298  normal  0.0918111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4522  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
472 aa  924    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.944611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4250  acyl-CoA synthetase  80.51 
 
 
467 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0676572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4020  acyl-CoA synthetase  80.51 
 
 
467 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4095  acyl-CoA synthetase  80.51 
 
 
467 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11217  acyl-CoA synthetase  76.6 
 
 
473 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  65.12 
 
 
468 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  62.02 
 
 
472 aa  541  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  58.24 
 
 
469 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  59.21 
 
 
469 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2982  acyl-CoA synthetase  58.22 
 
 
498 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.190971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  59.74 
 
 
466 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  50.75 
 
 
480 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3491  acyl-CoA synthetase  51 
 
 
467 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  50.42 
 
 
450 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  50.54 
 
 
478 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.904218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1436  AMP-dependent synthetase and ligase  47.61 
 
 
488 aa  309  8e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313554  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  43.23 
 
 
553 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 
502 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  37.37 
 
 
507 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 
495 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 
502 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
504 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 
493 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  38.44 
 
 
493 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 
501 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  34.89 
 
 
506 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
498 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  39.17 
 
 
533 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  40.99 
 
 
526 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  37.42 
 
 
506 aa  230  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 
507 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  34.08 
 
 
511 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  35.98 
 
 
501 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  34.2 
 
 
506 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  34.58 
 
 
504 aa  226  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  34.75 
 
 
504 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  36.5 
 
 
512 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  35.98 
 
 
501 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  36.06 
 
 
530 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  32.99 
 
 
536 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  33.41 
 
 
519 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  34.27 
 
 
539 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  35.88 
 
 
503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  34.5 
 
 
507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  34.28 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  33.19 
 
 
519 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  31.83 
 
 
507 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  34.73 
 
 
510 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  32.86 
 
 
517 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  35.44 
 
 
510 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  38.86 
 
 
511 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  33.06 
 
 
500 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  38.52 
 
 
517 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  33.75 
 
 
510 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  34.58 
 
 
504 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  39.48 
 
 
503 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  34.78 
 
 
508 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  31.85 
 
 
505 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  38.59 
 
 
503 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  32.2 
 
 
506 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  35.48 
 
 
503 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  37.54 
 
 
508 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 
559 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 
507 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  32.21 
 
 
510 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  36.23 
 
 
518 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  38.26 
 
 
485 aa  201  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  38.51 
 
 
504 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  37.25 
 
 
504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  38.29 
 
 
510 aa  196  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  37.25 
 
 
509 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 
521 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  35.25 
 
 
547 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 
500 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.9 
 
 
512 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
512 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.38 
 
 
514 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 
503 aa  193  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
485 aa  192  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  31.66 
 
 
504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  36.49 
 
 
504 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.66 
 
 
510 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.66 
 
 
510 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
522 aa  189  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03230  long-chain acyl-CoA synthetase, putative  35.05 
 
 
536 aa  189  9e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295256  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 
506 aa  189  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.45 
 
 
510 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 
510 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.45 
 
 
510 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 
510 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.45 
 
 
510 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 
487 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.51 
 
 
510 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  36.78 
 
 
509 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.51 
 
 
510 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.35 
 
 
518 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.24 
 
 
510 aa  186  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 
578 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>