More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4169 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4169  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
430 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2485  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  80 
 
 
430 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3703  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  64.65 
 
 
433 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353792  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3690  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  64.42 
 
 
433 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3763  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  64.42 
 
 
433 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7445  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  47.15 
 
 
418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  29.98 
 
 
454 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.33 
 
 
421 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  32.85 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  31.59 
 
 
607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  31.59 
 
 
607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  33.6 
 
 
428 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  31.13 
 
 
594 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  31.28 
 
 
626 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2056  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.09 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  29.9 
 
 
425 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.23 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  30.86 
 
 
552 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
538 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  32.1 
 
 
426 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.77 
 
 
427 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.77 
 
 
427 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3932  NADH dehydrogenase (quinone)  37.6 
 
 
422 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4588  NADH dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
414 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.31058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  30.05 
 
 
624 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  33.6 
 
 
432 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.99 
 
 
429 aa  176  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.73 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.13 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2587  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  34.87 
 
 
510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  33.42 
 
 
532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  30.1 
 
 
404 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.26 
 
 
446 aa  173  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
626 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  30.15 
 
 
427 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  30.15 
 
 
427 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  30.15 
 
 
427 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  29.88 
 
 
441 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  29.88 
 
 
441 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  29.88 
 
 
441 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  29.98 
 
 
623 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  30.57 
 
 
417 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  30.83 
 
 
417 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  29.66 
 
 
610 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  29.66 
 
 
545 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  30.22 
 
 
632 aa  171  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  31.36 
 
 
448 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1506  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.37 
 
 
452 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00816775 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  30.57 
 
 
417 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  33.07 
 
 
434 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  31.3 
 
 
626 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  31.02 
 
 
569 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  29.8 
 
 
438 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  33.26 
 
 
428 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  32.01 
 
 
430 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  32.03 
 
 
530 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.8 
 
 
436 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  31.85 
 
 
570 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1014  NADH dehydrogenase I subunit F  32.72 
 
 
433 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.84 
 
 
467 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.53 
 
 
436 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.8 
 
 
436 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.53 
 
 
436 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  29.87 
 
 
602 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  29.38 
 
 
545 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1080  NADH dehydrogenase I subunit F  32.72 
 
 
433 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  31.3 
 
 
535 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.53 
 
 
452 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1209  NADH dehydrogenase I subunit F  32.72 
 
 
433 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.53 
 
 
436 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  32.13 
 
 
433 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  30.15 
 
 
535 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  32.01 
 
 
441 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4300  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I, chain F  34.13 
 
 
414 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0070015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.22 
 
 
446 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 
604 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.99 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.2 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.53 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.99 
 
 
436 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2055  NADH dehydrogenase I subunit F  31.11 
 
 
433 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517668  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.99 
 
 
436 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  29.41 
 
 
571 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  31.02 
 
 
656 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
604 aa  167  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.02 
 
 
442 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  30.31 
 
 
435 aa  167  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  29.24 
 
 
545 aa  167  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  29.6 
 
 
456 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  28.87 
 
 
436 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  31.99 
 
 
436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  31.99 
 
 
436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  31.99 
 
 
436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  31.99 
 
 
436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.6 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  29.9 
 
 
535 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  31.75 
 
 
441 aa  166  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.72 
 
 
436 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.53 
 
 
426 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  31.48 
 
 
434 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>