More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3227 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  100 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  80.52 
 
 
231 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  78.12 
 
 
232 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  78.12 
 
 
232 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  77.68 
 
 
232 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  67.12 
 
 
224 aa  294  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  62.5 
 
 
226 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  59.55 
 
 
226 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  57.21 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  54.05 
 
 
227 aa  238  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  58.69 
 
 
224 aa  237  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  55.5 
 
 
226 aa  235  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  55.25 
 
 
243 aa  234  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  49.33 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  55.05 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  56.25 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  52.4 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  57.52 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  59.62 
 
 
245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  55.92 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  52.09 
 
 
248 aa  204  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  50.71 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  46.15 
 
 
221 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  43.52 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  45.95 
 
 
254 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  46.67 
 
 
222 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  47.89 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  42.08 
 
 
224 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  48.23 
 
 
238 aa  171  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  42.08 
 
 
224 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  50 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  38.36 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  40.72 
 
 
226 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.54 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
403 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  42.01 
 
 
266 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  40.18 
 
 
247 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  36.49 
 
 
398 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.72 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  34.76 
 
 
272 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.37 
 
 
276 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.85 
 
 
254 aa  138  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.05 
 
 
272 aa  138  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  37.23 
 
 
628 aa  136  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 
270 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43.06 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  36.65 
 
 
246 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  36.36 
 
 
277 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  36.65 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  37.39 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20550  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.28 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.55 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.74 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  36.92 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  34.84 
 
 
275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  39.66 
 
 
276 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  37.74 
 
 
239 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0887  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.754579  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  36.45 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
258 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  31.31 
 
 
277 aa  131  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  35.81 
 
 
282 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  34.4 
 
 
273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  34.4 
 
 
273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.84 
 
 
280 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.04 
 
 
277 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  35.59 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  36.53 
 
 
497 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  35.16 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.5 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0318  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.43 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.84205e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.58 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2617  ABC transporter related protein  34.93 
 
 
262 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.92 
 
 
255 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  36.02 
 
 
250 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.5 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.82 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.18 
 
 
252 aa  128  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.91 
 
 
294 aa  129  6e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  38.57 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  39.35 
 
 
481 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.67 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.21 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  36.28 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  36.76 
 
 
593 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  38.89 
 
 
568 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.55 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  35.62 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.31 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 
283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.82 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.57 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.94 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.67 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>