More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1621 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1621  pseudouridine synthase  100 
 
 		 285 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4820  pseudouridine synthase  73.33 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1278  pseudouridine synthase  75.62 
 
 		 287 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1251  pseudouridine synthase  74.2 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1268  pseudouridine synthase  74.2 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13329  hypothetical protein  73.21 
 
 		 305 aa  374  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0554  pseudouridine synthase  55.32 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28660  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  51.53 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.727795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5332  pseudouridine synthase  50.17 
 
 		 302 aa  258  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.776192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0431  pseudouridine synthase  50.35 
 
 		 317 aa  252  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4011  pseudouridine synthase  50.52 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0672  pseudouridine synthase  49.5 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0639  pseudouridine synthase  50.19 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4251  pseudouridine synthase  44.37 
 
 		 305 aa  225  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00270285  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0745  pseudouridine synthase  39.43 
 
 		 326 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0617  pseudouridine synthase  40.59 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3559  pseudouridine synthase  46.64 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2674  pseudouridine synthase  43.69 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03250  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  40.58 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243016  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2605  pseudouridine synthase  43.05 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1895  pseudouridine synthase  39.45 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1777  pseudouridine synthase  41.98 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0932  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  46.75 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2906  pseudouridine synthase  41.26 
 
 		 303 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4738  pseudouridine synthase  42.91 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4309  pseudouridine synthase  40.51 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08910  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  42.41 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.267328  normal  0.027473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2937  pseudouridine synthase  40.21 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.519419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20160  RNA pseudouridine synthase family protein  41.86 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1629  pseudouridine synthase  40.07 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2349  RNA pseudouridine synthase family protein  39.22 
 
 		 296 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1623  pseudouridine synthase  39.72 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449518  normal  0.260522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38090  putative pseudouridylate synthase  40.8 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3244  RNA pseudouridine synthase family protein  40.64 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1453  pseudouridine synthase  39.85 
 
 		 293 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3712  pseudouridine synthase  37.31 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3629  pseudouridine synthase  40.75 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3964  pseudouridine synthase  40 
 
 		 297 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0572  pseudouridine synthase  36.1 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0418  pseudouridine synthase  36.57 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08660  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  41.4 
 
 		 305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3537  pseudouridine synthase  36.57 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.966501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2133  pseudouridine synthase  39.02 
 
 		 313 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0519  pseudouridine synthase  37.26 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1330  pseudouridine synthase  35.79 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0166738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1652  pseudouridine synthase  39.33 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0549  pseudouridine synthase  37.45 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0482  pseudouridine synthase  37.2 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2953  pseudouridine synthase  36.25 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0506  pseudouridine synthase  37.55 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0459  pseudouridine synthase  36.53 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0433  pseudouridine synthase  36.16 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3881  pseudouridine synthase  35.42 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.792189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4073  pseudouridine synthase  36.96 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0445  pseudouridine synthase  36.16 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1531  pseudouridine synthase  33.2 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  0.216028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0257  pseudouridine synthase  34.69 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3557  pseudouridine synthase  34.91 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3348  pseudouridine synthase  34.94 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1212  pseudouridine synthase  34.36 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02575  pseudouridylate synthase  43.72 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2882  RluA family pseudouridine synthase  33.06 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1751  pseudouridine synthase  31.9 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0485075  normal  0.0112767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1430  pseudouridine synthase  33.64 
 
 		 223 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0213  pseudouridine synthase  35.68 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1883  pseudouridine synthase  39.66 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2488  pseudouridylate synthase  31.48 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0072  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 217 aa  89.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2529  pseudouridine synthase  31.92 
 
 		 578 aa  89  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1377  pseudouridylate synthase  32.41 
 
 		 223 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  36.67 
 
 		 623 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1460  pseudouridine synthase  30.48 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0606  pseudouridylate synthase  30.39 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2811  pseudouridine synthase  31.94 
 
 		 223 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0225697  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1506  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  32.56 
 
 		 215 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0155  pseudouridine synthase  32.56 
 
 		 215 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4024  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.17 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2896  pseudouridine synthase  31.28 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.76004  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  31.05 
 
 		 323 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2886  pseudouridine synthase  32.41 
 
 		 223 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1566  pseudouridine synthase  32.41 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232461  hitchhiker  0.00000912019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4330  pseudouridine synthase, RluA family  31.75 
 
 		 323 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2197  pseudouridylate synthase  32.87 
 
 		 224 aa  85.9  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2909  pseudouridine synthase  34.27 
 
 		 215 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2791  pseudouridine synthase  32.41 
 
 		 223 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1442  pseudouridylate synthase  31.98 
 
 		 223 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81175  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2804  pseudouridylate synthase  34.8 
 
 		 215 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.257511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2426  pseudouridine synthase  29.92 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1328  pseudouridine synthase RluA-like  29.49 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0969  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.18 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4177  pseudouridine synthase, RluD  31.75 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.463318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2524  pseudouridylate synthase  30.88 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349394  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0793  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.6 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0315  pseudouridine synthase  34.07 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2180  pseudouridine synthase, RluA family  34.81 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1467  pseudouridine synthase  31.34 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  35.27 
 
 		 560 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2968  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2226  pseudouridine synthase, RluD  30.08 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61490  DRAP deaminase and pseudouridylate synthase  28.09 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>