More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0889 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0889  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
367 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204318  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  50.13 
 
 
396 aa  338  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0983  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.99 
 
 
417 aa  330  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2986  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.87 
 
 
395 aa  315  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0217905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3093  oxidoreductase molybdopterin binding  44.72 
 
 
440 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.13966  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  41.6 
 
 
414 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.6 
 
 
414 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.1 
 
 
414 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2760  oxidoreductase molybdopterin binding  42.43 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.280905  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10220  transmembrane protein  39.8 
 
 
442 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0532075  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.29 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  36 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  36 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  34.85 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  36.55 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  34.09 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.82 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  37.12 
 
 
215 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  35.82 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  33.13 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  34.96 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  33.17 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  32.67 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2545  oxidoreductase molybdopterin binding  27.79 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  35.9 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  38.98 
 
 
241 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  31.66 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  34.56 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.62 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  34.09 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  34.06 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  32.85 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  35.14 
 
 
256 aa  67  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  33.87 
 
 
259 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  35.71 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.66 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  33.61 
 
 
258 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.84 
 
 
262 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  34.59 
 
 
262 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.84 
 
 
262 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.94 
 
 
262 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.39 
 
 
239 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  30.6 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  30.6 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  30.34 
 
 
428 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.85 
 
 
263 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  30.34 
 
 
428 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  33.9 
 
 
234 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.85 
 
 
263 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  35.56 
 
 
241 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  33.59 
 
 
259 aa  63.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  33.12 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  31.39 
 
 
262 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.39 
 
 
262 aa  63.5  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  32.35 
 
 
258 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.84 
 
 
266 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.59 
 
 
263 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  34.48 
 
 
234 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  36.76 
 
 
227 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.28 
 
 
229 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  32.09 
 
 
427 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 
259 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.06 
 
 
199 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.83 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  32.5 
 
 
234 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.83 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  33.05 
 
 
367 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  32.5 
 
 
234 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.39 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.81 
 
 
251 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  34.38 
 
 
554 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.65 
 
 
261 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.51 
 
 
237 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  30.81 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4179  oxidoreductase molybdopterin binding  35.82 
 
 
351 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0370615  unclonable  0.000000000255221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 
263 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.66 
 
 
262 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.17 
 
 
253 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.65 
 
 
517 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  31.9 
 
 
257 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.39 
 
 
200 aa  59.3  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  33.87 
 
 
233 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  29.75 
 
 
197 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  30.89 
 
 
259 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.15 
 
 
263 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  30.65 
 
 
259 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  33.61 
 
 
200 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  29.75 
 
 
197 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
249 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  27.86 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  27.53 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.41 
 
 
259 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  32.79 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  31.06 
 
 
461 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  31.06 
 
 
461 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  30.67 
 
 
451 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  31.62 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.94 
 
 
505 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>